结核性脑膜炎的潜在体液生物标志物研究

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背景结核性脑膜炎(Tuberculous meningitis, TBM)是由结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis, MTB)引起的中枢神经系统感染性疾病,约占结核病的7~10%,是以脑膜、大脑实质受损为主,并可波及脊髓、脊膜的非化脓性炎症。近年来由于人口流动频繁、免疫抑制剂广泛应用、耐药性结核菌株的出现及人免疫缺陷病毒的流行,TBM发病率有逐渐增高的趋势。而TBM的防治和诊疗过程中,早期准确的诊断与预后和治疗效果紧密相关联,因此准确有效的诊断方法在防治TBM中仍是当今亟待解决的重要医学问题。当前TBM的诊断主要依靠脑脊液(CSF)细胞、生化等检查。然而在TBM发生早期,CSF细胞学、生化变化多不典型,早期TBM诊断十分困难。本实验拟采用iTRAQ标记结合液相色谱串联质谱(iTRAQ—LC—MS/MS)的定量蛋白组学研究策略,比较TBM患者和健康对照CSF蛋白质表型,鉴定出TBM相关的差异蛋白质,为探讨TBM病理生理机制和筛选潜在诊断标志物提供新的证据。TBM常伴有血脑屏障的破坏,这使得TBM相关的代谢分子极易从CSF扩散至外周血液,提示检测TBM血液的代谢改变有望发现其潜在诊断标志物。本实验拟采用核磁共振(NMR)的代谢组学方法,筛选出TBM的潜在血液诊断标志物。目的1.采用iTRAQ的定量蛋白组学技术,分析TBM和正常的脑脊液蛋白质改变、筛选并验证TBM的潜在CSF蛋白质诊断标志物;2.采用核磁共振(NMR)的代谢组学方法,比较结核性脑膜炎患者与正常对照的血浆代谢谱,筛选TBM的潜在血浆代谢诊断标志物。方法1.第一部分:通过iTRAQ标记蛋白组学方法,比较TBM疾病组(n=12)和正常对照(n=12)脑脊液蛋白谱,通过液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)鉴定TBM相关的脑脊液差异蛋白,通过生物信息学分析对差异蛋白进行功能注释和通路分析。进一步将筛选出的潜在的生物标志物蛋白进行WB验证,并构建诊断模型进行诊断效能评估。2.第二部分:采用核磁共振(NMR)的代谢组学方法,比较结核性脑膜炎患者与正常对照的血浆代谢谱,筛选出结核性脑膜炎患者相对于健康对照者的血浆差异代谢物;分析差异代谢物的分子功能,初步探讨这些血浆差异代谢物在结核性脑膜炎发病中的潜在作用。结果1.使用iTRAQ定量蛋白质组学技术鉴别出81例差异蛋白质,对这部分蛋白质进行生物信息学分析,结果显示这些蛋白质的功能主要与凝血级联反应,炎症反应,细胞粘附密切相关。WB蛋白印迹实验验证结果指出NELL2水平在TBM疾病组相对于健康对照组呈现显著下降。ROC曲线分析结果提示NELL2的诊断效能:83.3%的敏感性和75%的特异性。该结果提示NELL2是TBM具有良好诊断效能的潜在生物标志物。2.采用核磁共振(NMR)偶联OPLS-DA的统计方法鉴定出TBM血浆相对于正常对照中的差异代谢物如下:有24个血浆差异代谢物质在结核性脑膜炎组与正常组区分中起主要作用(VIP>1.0)。N-乙酰糖蛋白(N-acetylglycoprotein)、丙酮酸盐(Pyruvate)、葡萄糖(Glucose)、烟酰胺(Nicotinamide)、1-甲基组氨酸(1-Methylhistidine)、葡萄糖-内酯(Glucono-delta-lactone)在结核性脑膜炎中的表达量增高;低密度脂蛋白(LDL)、极低密度脂蛋白(VLDL)、脂质(Lipid)、异亮氨酸(Isoleucine)、亮氨酸(Leucine)、缬氨酸(Valine)、谷氨酸(Glutamine)、蛋氨酸(Methoinine)、组氨酸(Histidine)、3-羟基丁酸酯(3-Hydroxybutyrate)、乙酸(Acetate)、丙酮(Acetone)、乙醇(Ethanol)、磷酸胆碱(PC)、甘油磷酸胆碱(GPC)、乙酰乙酸(Acetoacetate)、谷氨酰胺(Glutamate)、 N-甲基烟酰胺(N-Methylnicotinamide)在结核性脑膜炎中的表达量降低。四种生物标志物N-乙酰糖蛋白(N-acetylglycoprotein)、烟酰胺(Nicotinamide)、葡萄糖(α-Glucose,β-Glucose)经二元Logistical Regression分析,在训练集中可区分结核性脑膜炎患者与正常对照,AUC值为0.810。在测试集中,这四种生物标志物可区分12例结核性脑膜炎患者与13例正常对照,AUC值为0.827。在病毒性脑膜炎与结核性脑膜炎训练集中,这四种生物标志物的AUC值为0.782。结论1. NELL2可作为TBM潜在的生物标志物。2.通过TBM患者血浆的代谢组学分析,我们鉴定出TBM相关的血浆差异代谢物质。分析这些差异代谢物质的分子功能,并采用独立样本验证相关差异代谢物的临床诊断价值,为寻找TBM的客观诊断方法提供了候选标志物。
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