纤毛虫原生动物具有高度的物种多样性,且是水体微食物网中重要的能量传递枢纽,但针对一些特殊生境下纤毛虫原生动物生物多样性的研究仍然缺乏。上海崇明岛湿地,是国际上重要的湿地,孕育了丰富的生物资源,目前有关上海崇明岛独特的低盐泥质滩涂湿地纤毛虫物种多样性的研究非常匮乏。基于上述原因,作者于2015年起至今,运用直接采水法对上海崇明岛东滩和北滩的纤毛虫原生动物进行了一年的采集,并开展了以纤毛虫形态分类学为主的研究,以期通过对该区域内常见种和新纪录种详细的现代分类描述,厘清纤毛虫分类学上的混乱,进一步丰富纤毛虫多样性数据,同时也为此地区纤毛虫区系及生态学等相关研究提供一份手册性资料。主要研究结果如下:1.通过活体观察、蛋白银染色等纤毛虫现代分类学研究技术,共鉴定30种纤毛虫,隶属于7纲,15目,24科,26属。文中给出了 15个常见种的详细描述和物种的快速鉴定特征,及剩余15个常见种的形态。这些资料可为上海崇明岛地区的纤毛虫生态学等研究提供参考。2.建立了 1个新属:隐缝虫属Arcanisutura n.gen.,因其具不明显的、走向独特的前缝合线而明显区别于科内已知属。建立了 3个新种:崇明隐缝虫Arcanisutura chongmingiensis n.sp.,拟中华偏列虫 Apoholosticha parasinica n.sp.和崇明拉姆虫Lamtostyla chongmingiensis n.sp.。崇明隐缝虫的主要鉴别特征是虫体细长且末端呈尾状,具较少的(25-33条)体动基列和较多的(4-11个)伸缩泡开孔;拟中华偏列虫因虫体长,具数目较少的额棘毛、背触毛列,具3个伸缩泡和散布于腹面不规则的无色皮层颗粒而明显区别于属内已知种;崇明拉姆虫则因具较少的额腹棘毛和较多的大核同属内已知种明显区分开。3.3个已知种的崇明种群为中国的首次纪录,本工作对它们的分类学混乱、错误进行了厘清:(1)依据完整的形态学特征和统计数据,否定了舒迈瑞卡带膜虫 Zosterodasys shumerica Aliev,1990 是斜带膜虫 Z.transversa Foissner et al.1994的同物异名;(2)对被忽视已久的、描述不详细的尾马氏虫Marituja caudataObolkina,1995进行了详细的活体观察、纤毛图式及扫描电镜观察,并给出了该种的新定义;(3)对扁口游仆虫Eiplotes platystoma Dragesco&Dragesco-Kerneis,1986的活体特征进行了补足描述。4.首次报道了 6个已知种的低盐泥质滩涂湿地种群并对它们进行了形态学重描述:厚偏体虫Dysteria crassipes Claparede&Lachmann,1859、舒迈瑞卡带膜虫Zosterodasys shumerica Aliev,1990、青岛刺叶虫 Kentrophyllum qingdaoense Wu et al.,2015、显赫针口虫 Propostoma notate Mobius,1888、双核赭纤虫Blepharsma undulans Stein,1867 和异佛氏全列虫Holosticha heterofoissneri Hu&Song,2001。同时,也揭示了这些海水/淡水种对较低盐度的适应性。5.上海崇明岛湿地全年纤毛虫的时空分布规律表现为:异毛类及腹毛类为所有采集样点的主要类群;四季中,秋季的物种多样性最高;样地1的纤毛虫物种多样性最高,其次为样地2,而样地3及4的纤毛虫物种多样性又明显高于样地5。各样地间物种多样性的差异可能与其盐度、植被和底质类型相关。