计算机软件产业在互联网经济时代具有巨大的经济增长潜力，各国都非常重视软件的法律保护以促进本国软件产业的发展。同时，软件产业是一个国际化产业，任何国家都不可能闭门造车地发展软件产业。这就要求各国在软件立法保护的过程中互相协调、配合，以利于软件技术的交流和合作。当今，软件的法律保护所采取的版权模式却面临着新的挑战，本文从法律角度分析软件的定义入手，以维护我国利益、寻求权利人利益与公众利益的平衡为基础，研究计算机软件的知识产权保护方式问题。在评述软件各种保护方式的同时，着重分析了软件版权和专利权保护中的利益平衡，从而得出软件版权专利权混合保护模式能够满足我国软件产业发展的需要，又能适应软件业发展的国际往来。最后，本文提出了构建我国计算机软件知识产权保护制度的遵守的基本原则，并进行立法、司法思考。