大豆[Glyczine max(L.)Merr]起源于中国,是重要的粮食和油料作物。大豆蛋白质含有人体所需的各种氨基酸,特别是赖氨酸、亮氨酸、苏氨酸等人体必需氨基酸。含硫氨基酸含量是限制大豆营养价值的重要因素。近年来对大豆品质的改良尤其是含硫氨基酸含量提高成为研究重点。硫素营养对大豆有明显的增产作用,又能提高大豆种子中养分的质量。但随着作物产量提高,品种更新和复种指数增加,越来越多的硫素被带走。含硫肥料施用不足,氮肥磷肥施用泛滥,耕作层土壤有效硫含量降低,土壤缺硫现象严重。因此,对大豆耐低硫胁迫的研究意义重大。随着基因组测序技术的成熟和成本的下降以及生物信息学的发展,关联分析在作物遗传育种研究中的应用越来越广泛。然而国内外对大豆耐低硫基因型的筛选、鉴定和利用的研究较少,很多丰富而优良的耐低硫基因需要进一步挖掘。本研究以不同来源地的219份大豆自然群体为材料,利用室内水培的培养方法对苗期大豆耐低硫相关性状进行调查,对不同的表型性状进行系统评价,针对不同指标筛选出硫胁迫极端材料;此外,利用覆盖大豆全基因组的292053个SNP标记进行关联分析,鉴定出影响栽培大豆苗期形态学性状的显著SNP位点和与低硫胁迫相关性状的显著SNP位点,并通过公共数据库预测部分候选基因。结果表明,株高、根长、生物量以及叶绿素等表型有丰富的变异,可以作为硫胁迫研究的参考指标,并根据这些指标筛选出46个硫胁迫极端材料;三次筛选共关联到1110个显著SNP位点,其中在多个环境、多个性状重复关联到50个显著位点(-log(P)取4),分布在3号、4号、5号、14号以及18号染色体;预测到13个候选基因,分别为Glyma04g39370、Glyma04g39380、Glyma04g39390、Glyma05g04310Glyma05g04590、Glyma05g04600、Glyma05g31870、Glymal0g02540、Glymal2g34030、Glymal4g06981、Glyma14g07020、Glyma14g34856、Glyma18g07220,这些基因大部分编码酶,另外还有一些编码转录因子和转运蛋白。