目的：　　1.探讨全基因组高分辨率染色体微阵列分析（ChromosomeMicroarrayAnalysis,CMA）技术在骨骼系统发育异常（skeletalanomalies,SKA）并且染色体核型正常的胎儿病例中的应用价值。　　2.比较CMA技术与传统G-显带染色体核型分析在骨骼系统发育异常胎儿中检出率的差异性。　　3.探讨CMA技术在单纯SKA组和复合SKA组之间检出率的差异性。　　4.探讨CMA对骨骼系统发育异常胎儿的表型-基因学的研究。　　5.为建立骨骼系统发育异常胎儿病例的产前诊断思路及流程提供理论依据。　　6.为探讨应用CMA技术在产前诊断中如何最大程度降低不明确拷贝数变异（copynumbervariations,CNVs）。　　方法：　　1.研究对象：选取2012年6月至2015年5月因产前超声提示胎儿表现为骨骼系统发育异常，伴或不伴其他系统结构异常而至广州市妇女儿童医疗中心产前诊断中心门诊咨询并行侵入性产前诊断检测的孕妇，共计126例（排除超声表现为明显的致死性发育不良或软骨发育不良）。所有胎儿首先行常规G-显带核型分析，核型结果正常者进一步行CMA检测。根据是否合并其他系统结构异常，将胎儿样本分为单纯SKA组和复合SKA组。基于之前的研究，根据超声提示的不同骨骼系统异常表现，将两组再行亚组分类。　　2.按照标准操作流程使用QiagenDNA提取试剂盒提取胎儿样本（绒毛、羊水或脐血）的基因组DNA并使用NanoDrop分光光度计对DNA的浓度和纯度进行测量，符合标准才能进行CMA检测。　　3.根据美国Affymetrix公司提供的CytoScanHD芯片平台(包含195万拷贝数探针和75万单核苷酸多态性探针)的标准实验操作流程对样本DNA进行消化、连接、扩增、片段化、标记荧光信号、杂交、洗涤、染色以及扫描芯片。　　4.使用配套的CHAS软件对扫描后的芯片生成的文件进行转换和数据分析。　　5.参照本实验室的内部数据库、查阅相关国际公共数据库，如DGV、DECIPHER、OMIM、ISCA及UCSC在线数据库和同行实验室数据库等方法对CMA检测结果进行对比分析，判断CNVs的性质。　　6.采用统计学软件SPSS13.0中的χ2检验方法对单纯骨骼系统发育异常组和复合骨骼系统发育异常组之间的致病性检出率进行比较，定义P＜0.05时差异具有统计学意义。　　结果：　　1.126例胎儿样本行G-显带染色体核型分析提示5例为结果异常，染色体异常检出率为3.96％。核型结果分别为21三体、18三体、46,XX,der(15)t(9;15)(q12;q15)mat、46,XX,del(1)(q25,q32),del(2)(q23;q31)和46,XX,der(5)各一例。剩余的121例胎儿核型结果均正常，进一步行CMA检测。　　2.CMA在121例核型正常的胎儿样本中均检测到CNVs，CNVs的检出率为100%（121/121）。其中在11例胎儿中检出致病性CNVs，致病性CNVs的检出率为9.09%。CMA将骨骼系统发育异常胎儿的总体检出率提高到12.70%（16/126）。在4例（3.31%）胎儿中检出临床意义不明确CNVs（variantsofunknownsignificance,VOUS），在106例（87.6%）胎儿中检出良性CNVs。　　3.在11例致病性CNVs中其中4例为单纯SKA组，7例为复合SKA组，致病性检出率分别为8.89%和9.21%，后者比前者检出率稍高，但无统计学意义（Fisher’s检验，P＞0.05）。在单纯SKA组中，肢体异常组（不包括长骨短及姿势异常）的致病性检出率最高，占20.0%（1/5），而复合SKA组中，长骨短组致病性检出率最高，16.67%（3/18）。　　4.在11例致病性CNVs中，有3例为已知的缺失综合征，包括22q11.2缺失综合征2例，22q13.3缺失综合征1例。其余8例分别为1q21.1缺失、10q24.3重复、10q22.3缺失、Xp22.33重复、17q24.3缺失2例、Xq11.21重复和4q24缺失，均在DECIPHER数据库、OMIM数据库或其他数据库中覆盖已知致病片段或致病基因。致病性片段所涉及的致病基因有SOX9、KCNJ2、FBXW4、PRKAB2和SHOX等。　　5.CMA在最初检出12例VOUS，进一步对其父母双方行CMA检测，发现8例遗传自健康父母之一，判定为良性。其余4例为新发，判定为VOUS，检出率为3.31%。4例VOUS分别为11p15.4缺失(213kb,5488908-5701819),18p11.21重复(361kb,11451658-11812360),9q31.1重复(366kb,107393791-107760227)和8p23.3缺失(216kb,1968003-2183673)。　　结论：　　1.CMA在染色体核型正常的骨骼系统发育异常胎儿中的检出率额外提高了9.09%，使整体检出率提高至12.70%，说明骨骼系统发育异常与染色体微缺失/微重复有一定相关性，建议染色体核型正常的骨骼系统发育异常的胎儿进一步行CMA检测，排除染色体微缺失/微重复可能性。　　2.CMA在单纯SKA组及复合SKA组的致病性CNVs检出率未见统计学差异。　　3.通过CMA检测，检出致病性CNVs片段中与胎儿骨骼系统发育异常的表型-基因相关，致病基因有SOX9、KCNJ2、FBXW4、PRKAB2和SHOX等。　　4.在产前超声发现有骨骼系统发育异常的胎儿时，建议行侵入性产前诊断，首先行G-显带染色体核型分析，排除染色体异常可能；如染色体核型正常者再进一步行CMA检测，排除染色体微缺失/微重复可能，甚至可明确致病基因，指导下一胎妊娠。　　5.随着CMA技术的进步，其分辨率也愈发增加，VOUS的检出率也会提高，通过对父母外周血行CMA检测，以协助解释不明确CNVs的性质，从而降低VOUS的检出率。