隐孢子虫(Cryptosporidium)和毕氏肠微孢子虫(Enterocytozoon bieneusi)是比较常见的肠道寄生性原虫,可通过食源传播并感染人,广泛寄生于各种动物及人的呼吸道和消化道内,以严重的腹泻为其典型症状,大部分人可引起自限性腹泻,免疫缺陷的宿主可能导致严重的损伤甚至死亡。从开封市宠物医院、狗市和犬舍采集了 412份犬新鲜粪样,初步镜检后,采用分子生物学巢式PCR技术,对所得到的阳性样品进行序列测定:检测两种病原体,区分不同的基因型和种属;同时通过卡方检验,对比不同年龄犬阳性率的差异。结果显示:隐孢子虫的感染率为0.2%(1/412),毕氏肠微孢子虫的感染率为31.8%(131/412),两者差异极显著(P<0.01);不同年龄犬的感染情况表明,两种病原体幼龄犬混合感染率36.5%(62/170),显著高于成年犬27.9%(50/179)和老年犬30.2%(19/63)(0.01<P<0.05),说明这两种虫体容易侵袭机体免疫力差的幼犬;不同性别的犬雌性感染率 30.5%(54/177),雄性感染率 33.6%(77/235),两者之间差异不显著(P>0.05)。巢式PCR以及种的鉴定结果表明,在犬粪便样品中检测到的隐孢子虫阳性虫体为C.canis型;毕氏肠微孢子虫基因型的鉴定结果显示,在犬中检测到的阳性基因型分别为PtEbⅨ、CD9、CD7、HenanⅣ和NEC1基因型,其中PtEb Ⅸ是优势基因型;隐孢子虫C.canis是已知可感染人的病原体。毕氏肠微孢子虫PtEb Ⅸ、CD9、CD7、Henan Ⅳ和NEC1基因型具有感染人的风险。开封地区犬感染隐孢子虫和毕氏肠微孢子虫,多种动物存在安全隐患。在传播方面,应将其卵囊监测常规化;对于易感染群体,尤其是免疫力低下的动物,应加强隔离消毒,切断感染源,加强营养提高其免疫力;已患病的群体,尽量采用新型药物应积极治疗,将其扼杀在萌芽状态;重视预防工作,制定一套综合防制措施,控制其传播。