柿甘涩相关性状的关联分析

来源 :中国林业科学研究院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:bbben
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本文以150份柿种质资源为材料,通过对表型性状分析和细胞分析得到了柿甘涩相关性状,为关联分析奠定表型性状基础;转录组测序、候选基因的扩增及分析得到相关基因型,表型与基因的关联分析得到了相关的标记位点,为柿甘涩性状分子标记辅助育种奠定基础。相关研究结果如下:1、种质资源评价:柿种质资源圃的150份柿种质资源包括果实、种子、髓心、果蒂、萼片及果柄六个部分共56个表型性状,并且表型性状变异丰富。果实的表型性状反应果实的大小、形状、理化性质及果实颜色方面,种子长宽比均值为1.81,所有柿果髓心均为实心,果蒂偏圆形和方形,有凸起、扁平和凹陷之分,果柄由远离果实的一端到果实一端呈现逐渐增粗的特点。2、多样性分析:柿种质资源的R型聚类可将56个表型指标分为六个类群,指标间的相关性分析及R型聚类表明柿种质资源间大小性状和形状指标分别存在相关关系。主成分分析提取前八个指标,解释82.459%的变异。Q型聚类可将150份柿种质资源聚为3类,各类具有其相应的果实大小及形状特点。3、细胞切片分析:成熟期柿果实细胞分析,共包含34个指标,28个属于中等变异,6个属于强变异。柿果实表皮厚度和层数平均值分别为87.39 um和4.1层,果皮厚度平均值为624.69 um,横切面单宁细胞大部分偏圆形,纵切反应单宁细胞的形态特征。果肉薄壁细胞横和纵切面主要为圆形,单位横切面维管束个数为1个/mm~2。相关性分析表明,细胞层厚度与细胞层数呈显著性正相关关系,果肉中若维管束个数越多单宁细胞的个数也就越多。单宁细胞的形态有聚合和分散之分,甜柿单宁细胞小且较为分散,涩柿单宁细胞大且较为密集。4、甘涩相关性状分析:柿种质资源可溶性单宁含量均值为14.61 g/kg,将可溶性单宁含量与柿果表型及细胞进行相关性分析,具有显著性相关的性状称为柿果的甘涩性状。可溶性单宁含量与柿果大小性状呈负相关关系,与可溶性固形物含量、横和纵切单位果肉面积内的单宁细胞个数呈正相关关系。为定量果实大小和形状指标,本文将与可溶性单宁含量相关的柿果实、种子及髓心大小和形状指标做主成分分析(PCA),得到FAC1和FAC2分别表示果实的大小和形状指标。因此,确定柿果的甘涩性状指标有:大小及形状指标(FAC1和FAC2)、可溶性单宁含量(STC)、可溶性固形物含量(FSSC)、横和纵切面单位面积内单宁细胞数(NTC和NTF)六个指标。5、关联分析:转录组关联分析中,150份柿种质资源划分为3个群体,6个甘涩性状通过关联分析得到32个SNP位点,贡献率在21.41%~32.34%之间,其中位点DKsnp234075、DKsnp90928和DKsnp482415与植物抗性蛋白有关。Dk PA1基因共发现34个多态性位点,与甘涩性状进行关联得到9个SNP多态性位点,大部分甘涩性状多态性位点位于内含子和外显子2上,SNP位点287、874、880和994可后续作为甘涩性状的分子标记位点。综上所述:浙江省兰溪市苗圃柿种质资源果实表型性状变异丰富,种质资源评价得出了柿种质资源表型变异特点,相关性分析表明柿果实种质资源间大小和形状指标分别存在相关关系。细胞分析表明柿种质资源细胞水平变异丰富,展示了横和纵切单宁、薄壁细胞大小及形态特征。可溶性单宁与表型性状及细胞性状相关性分析,得到六个甘涩相关性状。转录组关联分析筛选出了三个与植物抗性蛋白有关的SNP位点,候选基因的关联分析得到四个可后续作为甘涩性状的分子标记位点。
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