全球军事科技竞争的加剧，“南海争端”问题凸显以及海洋资源争夺愈加激烈等，都对我国海港建设提出了更高的要求。港口作为陆地与海洋交汇的枢纽，自身的发展对于其连接着的两块领域有至关重要的作用。将科技与军事结合，科学管理港口事务，实现国防军事与民事科技的协同创新，提高港口经济贸易水平与应急能力，具有十分重要的现实意义。　　本文基于港口物资管理系统特征，结合港口应急物资管理的相关理论，阐述了港口物资应急管理系统的作用及其结构特点。然后从军民融合视角根据系统结构，将和平状态港口物资管理系统与非和平状态港口物资管理系统结合起来，构建新型港口物资应急管理系统。运用演化博弈法构建该港口物资应急管理系统的支付博弈矩阵，通过分析支付矩阵决策是否构建该系统。采用动态规划法构建相应的系统模型，并分析不同情境下模型的策略稳定点。本文分三步检验该模型，第一步构建雅可比矩阵，求得矩阵的行列式和迹，找出不同情境下的策略稳定点，检测模型稳定性。第二步采用博弈演化图直观分析策略稳定点的变动情况，并分析动态情境包括军事冲突状态下的策略点走向，检验模型可靠性。最后，将模型对北部湾某港口进行实例应用，先结合德尔菲法获得的参数运行模型得到计算结果，接着假设港口处于战争状态再次运行模型，以验证模型的适用性。最终得出结论为：在某一情境（非战争状态）下该模型的适用性最高，然而考虑到港口状态的多样性包括军事冲突状态，该港口管理者很有可能选择合作策略，构建新型港口物资应急管理系统。　　该新型港口物资应急管理系统模型的构建为港口应急物流以及军民融合协同创新领域的研究，提供了新的参考思路与借鉴价值。