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目的:越来越多的研究显示长链非编码RNA的异常调节与乳腺癌有关,linc-ROR(long intergenic non-protein coding RNA, regulator of reprogramming)作为一种长链非编码RNA同样也被报道可作为乳腺癌的潜在靶标,但linc-ROR在乳腺癌中的具体调节机制尚未得到充分报道。本研究旨在探索linc-ROR如何影响乳腺癌的增殖、转移及其对相关治疗药物的敏感性。
材料:收集20例乳腺癌组织及16例癌旁组织,用实时荧光定量PCR检测组织中linc-ROR的表达量。通过在人乳腺癌细胞系MCF-7中构建linc-ROR过表达和敲除的细胞系来检测linc-ROR对乳腺癌细胞增殖、克隆形成、转移和侵袭能力的影响。此外,用CCK-8细胞活性实验检测linc-ROR在乳腺癌细胞对雷帕霉素敏感性中的影响。提取linc-ROR过表达细胞系及其阴性对照细胞系的总RNA做二代测序,通过对比测序结果筛选出全转录组差异表达的RNA,预测这些RNA的靶基因并进一步做GO(Gene Ontology)分析、KEGG(Kyoto Encyclopedia ofGenesand Genomes)通路分析、蛋白互作网络分析以及竞争性内源RNA(competing endogenousRNA,ceRNA)分析等。基于以上生物信息学分析筛选出来的ceRNA调节通路,通过双荧光素酶报告基因实验、实时荧光定量PCR、蛋白印迹法及相关回补实验来验证其在调节乳腺癌增殖、转移及其对雷帕霉素敏感性中的作用。
结果:linc-ROR在乳腺癌组织中高表达,linc-ROR可以促进乳腺癌细胞增殖、克隆形成、转移和侵袭。此外,linc-ROR可以降低乳腺癌细胞对雷帕霉素的敏感性。全转录组测序结果显示,linc-ROR的过表达引起了乳腺癌细胞中85个长链非编码RNA、414个微小RNA、490个信使RNA和92个环状RNA的差异表达。通过进一步的生物信息学分析,发现linc-ROR可作为ceRNA分子海绵竞争结合miR-194-3p并引起其靶基因MECP2(methyl-CpG-binding protein 2)的异常表达,从而引起相应的生物学效应。“linc-ROR/miR-194-3p/MECP2”这一ceRNA调节轴也通过实时荧光定量PCR、蛋白印迹法以及双荧光素酶报告实验得到验证。同时,回补试验也证实了miR-194-3p/MECP2调节轴参与了linc-ROR介导的乳腺癌进程及对药物敏感性的调节作用。
结论:linc-ROR可作为分子海绵竞争结合miR-194-3p,下调miR-194-3p表达来解除其对MECP2的抑制作用,从而促进乳腺癌进展并提高乳腺癌细胞在雷帕霉素治疗环境中的生存率。
材料:收集20例乳腺癌组织及16例癌旁组织,用实时荧光定量PCR检测组织中linc-ROR的表达量。通过在人乳腺癌细胞系MCF-7中构建linc-ROR过表达和敲除的细胞系来检测linc-ROR对乳腺癌细胞增殖、克隆形成、转移和侵袭能力的影响。此外,用CCK-8细胞活性实验检测linc-ROR在乳腺癌细胞对雷帕霉素敏感性中的影响。提取linc-ROR过表达细胞系及其阴性对照细胞系的总RNA做二代测序,通过对比测序结果筛选出全转录组差异表达的RNA,预测这些RNA的靶基因并进一步做GO(Gene Ontology)分析、KEGG(Kyoto Encyclopedia ofGenesand Genomes)通路分析、蛋白互作网络分析以及竞争性内源RNA(competing endogenousRNA,ceRNA)分析等。基于以上生物信息学分析筛选出来的ceRNA调节通路,通过双荧光素酶报告基因实验、实时荧光定量PCR、蛋白印迹法及相关回补实验来验证其在调节乳腺癌增殖、转移及其对雷帕霉素敏感性中的作用。
结果:linc-ROR在乳腺癌组织中高表达,linc-ROR可以促进乳腺癌细胞增殖、克隆形成、转移和侵袭。此外,linc-ROR可以降低乳腺癌细胞对雷帕霉素的敏感性。全转录组测序结果显示,linc-ROR的过表达引起了乳腺癌细胞中85个长链非编码RNA、414个微小RNA、490个信使RNA和92个环状RNA的差异表达。通过进一步的生物信息学分析,发现linc-ROR可作为ceRNA分子海绵竞争结合miR-194-3p并引起其靶基因MECP2(methyl-CpG-binding protein 2)的异常表达,从而引起相应的生物学效应。“linc-ROR/miR-194-3p/MECP2”这一ceRNA调节轴也通过实时荧光定量PCR、蛋白印迹法以及双荧光素酶报告实验得到验证。同时,回补试验也证实了miR-194-3p/MECP2调节轴参与了linc-ROR介导的乳腺癌进程及对药物敏感性的调节作用。
结论:linc-ROR可作为分子海绵竞争结合miR-194-3p,下调miR-194-3p表达来解除其对MECP2的抑制作用,从而促进乳腺癌进展并提高乳腺癌细胞在雷帕霉素治疗环境中的生存率。