目的:研究伴甲状腺发育不全的先天性甲状腺功能减低症(congenital hypothyroidism,CH,简称先天性甲低)患儿PAX8和HHEX基因突变类型和特点,并初步探讨PAX8突变导致甲状腺发育不全(thyroid dysgenesis,TD)的遗传方式,为CH患儿的基因诊断和基因治疗提供理论依据。方法:首先对选取的63例TD患儿抽取外周血,进行基因组DNA提取,然后PCR扩增PAX8基因,对PCR产物进行直接测序,利用生物信息学软件对63例PAX8测序结果分析。另外,利用同样的方法对234例TD患儿进行HHEX基因突变筛查。结果:对63例PAX8基因测序结果分析,在1例伴缺如的TD患儿中发现1个错义突变c.155G/C,p.Arg52Pro。为进一步研究PAX8的遗传方式,对其正常父母进行PAX8基因突变筛查未发现突变,表明此患儿所得TD为新生突变(de novo mutation)所引起的。分析234例HHEX基因测序结果,在编码区未发现任何突变,但在第2内含子区发现1个SNP位点(rs2275729,IVS2+127 G/T,变异频率为5.13%)。然后,利用SPSS 17.0统计学软件对TD组和MAF最小等位基因频率进行比较,结果显示两组之间等位基因频率差异无显著性(P>0.05),该SNP位点与TD的发生无相关性。结论:PAX8基因在中国山东地区甲低患者中突变率很低,新生突变能很好的解释TD多为散发性的特点,为TD的发病机制提供了新的理论依据,PAX8基因新生突变与甲状腺发育异常有关。同时证实HHEX基因突变率在中国山东地区甲低患者中很低,可能不是山东地区甲低患者的致病基因。