利用SSR和SRAP标记检测春大豆遗传多样性

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本试验运用SSR和SRAP分子标记对77份主要来自四川省的春大豆种质资源进行了遗传多样性分析,主要研究结果如下:1.分别筛选了30对SSR引物和19对SRAP引物,得到多态性条带的比率分别为100%和72.5%。其中30个SSR位点共检测到127个等位变异,平均为4.23个,每个SSR位点的Simpson指数的分布范围为0.2962-0.7634,平均值为0.5358,Shonnon-weave指数分布范国为0.4226-1.4985,平均值为0.9942。19个SRAP位点共检测到148个等位变异,平均为7.79个,每个SRAP位点的Simpson指数的分布范围为0.6094-0.9098,平均值为0.8278, Shonnon-weave指数分布范围为1.2357-2.0322,平均值为1.6955,表明了所选材料有丰富的遗传多样性。2.综合SRAP和SSR的数据,建立0、1矩阵,计算相似系数,并通过UPMGA聚类分析,获得树状图。结果显示,77份春大豆种质资源间的相似系数介于0.5942和0.9058之间,以相似系数0.72为阈值,可将77份春大豆种质资源分为4大类:第Ⅰ类仅含1份材料,占供试材料的1%,为来自四川雅安的野生大豆“野豆1号”,与栽培大豆亲缘较远而单独聚为一类;第Ⅱ类也仅含1份材料,占供试材料的l%,为来自四川自贡的育成品种“贡22-6”,与其他栽培大豆亲缘关系较远,单独聚为一类:第Ⅲ类包含3份材料,占供试材料的4%,分别是来自辽宁的东北大豆、大粒黄豆和来自四川雅安的90-55;第Ⅳ类包含72份材料,占供试材料的94%,分别来自四川南充、自贡、成都、雅安、古蔺、乐山,以及重庆巫山、石柱和辽宁铁岭、安徽合肥等地。第Ⅳ类又可分为6个亚类:Ⅳ-1仅含1份材料,为来自辽宁的“铁丰25”;Ⅳ-2包含4份材料,分别是来自四川茂县的富2003-2、富2008,四川自贡的贡89-1和四川雅安的94-1;Ⅳ-3也仅含1份材料,是来自重庆北碚的“西豆3号”;Ⅳ-4包含3份材料,分别是来自四川雅安的川豆6号和4515,重庆巫山的半野豆2号;Ⅳ-5包含3份材料,分别是来自四川自贡的贡88-6、四川南充的南107-23和四川茂县的富2003-2(选);Ⅳ-6包含了60份材料。3.通过对SRAP标记和SSR标记之间遗传相似系数矩阵进行Mantel检测,r=0.5896,p<0.05。结果显示两种分子标记技术对春大豆种质资源遗传多样性分析的结果有一定差异,可能是两种分子标记的原理不同,作用区域不同所致。而SSR和SSR+SRAP数据之间的相关系数r=0.8429,p<0.01,两者匹配良好,SRAP和SSR+SRAP数据之间的相关系数r=0.9316,p<0.01,两者同样匹配良好。表明将SSR和SRAP分子标记综合应用能更好地进行春大豆种质资源的鉴定和分类。
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