卡特利链霉菌A520基因文库的构建以及硫霉素生物合成基因的初步研究

来源 :中国协和医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:guaiguainiu1
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用大肠杆菌/链霉菌穿梭载体pKC505在大肠杆菌DH1中构建了卡特利链霉菌A520的基因文库,基因文库由4000个转化子组成,插入的外~1源DNA片段的大小为20—30kb,所含重组质粒的频率很高,基因组的覆盖率在99%以上,基因文库中的重组质粒在—70℃保存两年后检测重组,酶切带型没有变化,重组质粒DNA没有发生重排,基因文库稳定。 根据基因同源性不同杂交严谨度要求不同的条件,应用三个来源的DNA探针杂交筛选基因文库,筛选进行了在不同的严谨度下首在不同的严谨度下先进行了预实验,用卡特利链霉菌A520硫霉素环化酶基因tcs上游1.5kb片段杂交筛选基因文库,得到32个阳性克隆(pKW101—pKW132),用利波曼链霉菌的IPNS基因杂交筛选得到一个阳性克隆pKW201,用带小棒链霉菌的cs2基因为探针杂交筛选得到一个阳性克隆pKW301。 转化阳性克隆的重组质粒到变铅青链霉菌TK24中,转化子在不同的培养基发酵,以对青霉素G不敏感的沙雷氏菌AG4410为指示菌,进行了活性物质的检测,从4000个转化子中得到变铅青链霉菌转化子(pKW102)和(pKW105)产生对指示菌有抑制作用的活性物质,重组质粒pKW102和pKW105中插入的外源DNA片段为25.3kb和29kb,提示该外源DNA片段可能成在编码硫霉素生物合成基因。 通过Southern杂交分析表明质粒pKW201含有与利波曼链霉菌的IPNS基因、与卡特利链霉菌A520硫霉素tcs基因和与带小棒链霉菌中克拉维酸中cs2基因同源的DNA片段,它们分别位于pKW201/BamHI 2.7kb,4.3kb,和1.9kb的DNA片段上。因此,对pKW201进行了深入的研究。绘制了pKW201限制性酶切图谱并将其BamHI酶切后的外源DNA片段亚克隆到pUC18中,得到pKWG1,pKWG2,pKWG3,pKWG4,pKWG5,pKWG6,pKWG7,pKWG8重组质粒,pKW201含有22.9kb的DNA片段,与IPNS基因同源的DNA片段位于pKWG4上,与tcs基因同源的DNA片段位于pKWG3上,与:cs2基因同源的DNA片段位于pKWG6上。tcs基因紧位于IPNS基因上游,与带小棒链霉菌cs2同源的DNA片段位于IPNS基因下游的2.0kb处。 测序分析结果证实,与利波曼链霉菌IPNS基因同源片段为IPNS基因,其转录方向也与其它β—内酰胺产生菌中的IPNS的转录方向和终止位置一致。 用染色体步移法,以IPNS基因为中心,对位于其上游的tcs基因上游的1.5kb的DNA片段进行了测序,序列测得1097bp个核苷酸,DNA序列分析和编码的氨基酸序列同源性比较表明G+C%为75.3,符合链霉菌GC含量高的特点,由其编码的氨基酸序列和tcs编码的一起与点黄青霉菌的
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