甘蓝、白菜和拟南芥bZIP基因的同源进化分析及功能研究

来源 :西北农林科技大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zhuguangxinli
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
bZIP(Basic Leucine Zipper)型转录因子参与调控植物的生长发育,并且在应对环境胁迫中发挥重要作用。研究发现,ABI5类bZIP型转录因子ABI5(ABA Insensitive 5)和ABFs(Abcisic Acid Responsive Element Binding Factors)在ABA应答反应中起关键作用,它们可以发生磷酸化、SUMO化等多中蛋白质翻译后修饰。前期,已完成对白菜BrbZIP型转录因子的全基因组注释。但是,甘蓝中的BobZIP型转录因子的全基因组注释及其生物学功能还有待研究。本研究通过全基因组水平对甘蓝和白菜的bZIP家族进行注释分析,并对甘蓝和白菜A亚家族bZIP型转录因子的结构和功能进行比较研究,取得如下结果:(1)通过全基因组注释分析发现,甘蓝中编码131个bZIP同源基因,白菜中编码136个;蛋白进化分析表明,甘蓝和白菜的A~S 10个亚家族都有bZIP同源基因,其中甘蓝有22个属于A亚家族,白菜中有23个属于A亚家族;(2)通过对甘蓝、白菜和拟南芥的A亚家族bZIP型转录因子的同源基因与蛋白质结构进行比较分析发现,基因和蛋白结构都高度保守;(3)基于转录组测序结果构建的基因表达图谱发现,A亚家族BobZIPs和BrbZIPs基因在不同的器官中表达量有差异,而且基因大部分在愈伤组织、根和长角果中高表达;进一步通过qRT-PCR,发现ABA可以诱导白菜多数A亚家族的BrbZIPs基因高表达,包括ABI5等同源基因;(4)对甘蓝和白菜ABI5同源基因的分子克隆与序列分析发现,甘蓝、白菜ABI5同源基因含有AtABI5蛋白的保守结构域,包括四个保守位点和NLS(Bipartite Nuclear Localization Signal)双组份核定位信号,bZIP结构域以及SUMO化修饰位点;(5)成功构建基于CRISPR-Cas9编辑技术敲除甘蓝和白菜的ABFs同源基因的载体,成功获得再生苗;综上所述,经过基因和蛋白结构以及生物学功能进行比较分析发现,甘蓝、白菜的bZIP同源基因与拟南芥高度相似;本研究基于bZIP型转录因子调控ABA或干旱逆境胁迫相关基因的注释与功能研究,将有助于甘蓝、白菜和甘蓝型油菜的ABA调控相关基因的生物学功能研究。
其他文献
上个世纪80年代中期,科学家们意识到自旋交叉配合物与价态互变异构化合物可作为显示、信息存储、传感和光学开关等分子材料,因而引发了研究热潮。某些含有过渡金属的配合物,
随着绿色化学理念的不断发展,人们对催化剂提出了更高的要求,推动着科研人员对催化剂进行更加深入的研究。非均相催化剂作为催化剂的重要组成部分,具有易于分离、循环能力强
FDM(Fused Deposition Modeling)作为3D打印家族的成员之一,得益于自身的耗材种类多、成型过程环保、设备结构简单、运行稳定等优势,其在生产加工等诸多领域得到了广泛运用。但随着FDM技术的运用范围愈加广泛,该技术存在的加工尺寸有限、成型质量低、成型件力学性能差等问题也逐渐暴露。故笔者以成型件的尺寸误差和力学性能研究对象,并通过实验研究分别确定了最佳的工艺参数组合和路径规划方
活性污泥是废水生物处理中不可避免的副产物,成分复杂、含水率高,污泥处理处置已成为污水处理厂的主要挑战之一。本论文针对污泥脱水和减量化,研究了超声-酸化(acidification
面对化石能源的过度消耗和不断增长的能源需求,开发可持续能源具有至关重要的作用。利用光催化技术将太阳能转化为化学能是一种缓解能源短缺问题的有效途径。氢气具有高能量
频谱激电法主要根据介质的导电性差异与极化性差异进行地质勘察。该方法具多参数的特点,能够给物探人员提供识别异常更丰富的途径。因为轻便、快捷、效率高的优点,此法在资源
目的:探究雌激素对氯吡格雷引起的胃黏膜二次损伤是否存在保护作用及可能的机制。方法:首先收集东南大学附属中大医院的既往有胃溃疡住院患者的相关临床资料,排除无病理资料或病理资料不支持胃溃疡的患者,后查阅临床资料将患者分为两组(有氯吡格雷服用病史的一组,另一组为不服用氯吡格雷的患者),后调取两组患者的病理蜡片标本进行免疫组化染色,观察ERa的表达情况,用半定量的方法观察两组患者胃粘膜中的表达情况。通过细
面对日益严峻的环境问题,本论文从环保天然生物材料代替传统材料切入,发现以细菌纤维素(红茶菌)为例的大部分天然生物材料在应用过程中存在价格高、量产难、应用领域窄等问题
第一部分超声自动乳腺全容积扫描成像对乳腺癌新辅助化疗效果评估目的:乳腺癌是女性最常见的恶性肿瘤,位于发病率之首。新辅助化疗(neoadjunvant chemotherapy,NAC)逐渐成为
随着经济全球化与网络大数据时代的到来,金融银行正在经历转型升级的时期,面对金融国际化、网络金融等一系列挑战,出现了产品服务单一、客户忠诚度下降、客户流失的情况。而