中华绒螯蟹VEGFR基因在螺原体感染过程中的功能研究

来源 :南京师范大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:gaiwenru
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis),不同地域对其称呼也有所不一样,常见的称呼有河蟹或者大闸蟹,有的地域称为清水蟹或者毛蟹。随着养殖强度、面积的不断扩大及水域环境的日趋恶化,中华绒螯蟹养殖过程中的病害问题愈来愈严重。其中“颤抖病”是制约我国中华绒螯蟹养殖产业可持续发展的主要瓶颈之一。前期研究证实一种螺原体(Spiroplasma eriocheiris)为中华绒螯蟹“颤抖病”的病原体,该病原通过鳃或体表进入蟹体内,侵染其靶细胞——血淋巴细胞,并通过血液的循环进而侵染各器官结缔组织,前期中华绒螯蟹感染螺原体后表现为无力、不食,后期病原大量侵染神经组织主要表现为附肢颤抖,直至死亡。因此,探究中华绒螯蟹的免疫防御机制,对减少该病原对中华绒螯蟹的损失具有十分重要的意义。本论文首先利用串联质谱标签(TMT)技术和液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)技术,筛选出了螺原体侵染血淋巴细胞早期的差异表达蛋白;而后通过RACE技术扩增得到了中华绒螯蟹血管内皮生长因子受体(Vascular endothelial growth factor receptor,EsVEGFR)基因全长,并分析了其序列特征、表达模式;最后通过基因干扰等实验研究了EsVEGFR在螺原体侵染过程中的作用。本论文为明确螺原体的侵染机理以及中华绒螯蟹的防御机制奠定了良好的基础,本研究主要从以下三个方面展开:1.TMT(串联质谱标签)技术筛选螺原体感染前后中华绒螯蟹血淋巴细胞的差异蛋白通过TMT技术筛选螺原体感染中华绒螯蟹蟹血淋巴细胞早期(24 h)差异表达的蛋白,筛选出差异蛋白共212个,其中上调蛋白127个、下调蛋白85个,它们与细胞骨架、免疫、生理过程等相关,其中42个差异蛋白与免疫相关。上调蛋白包括组织蛋白酶L(cathepsin L)、谷胱甘肽s-转移酶(glutathione s-transferase,GST)、凝血因子B/B2(clotting factor B/B2)、黑化作用蛋白酶1(melanization protease 1)、丝氨酸蛋白酶抑制剂(serine protease inhibitor)、过氧化物酶1(peroxiredoxin 1,Prx1)等。下调蛋白包括铁蛋白2/3(ferritin2/3,Fer2/3)、凝集素(lectin)、脂多糖-1,3-葡聚糖结合蛋白(Lipopolysaccharides-1,3-glucan binding proteins,LGBP)、血管内皮生长因子受体蛋白1(Vascular endothelial growth factor receptor 1)、NADPH氧化酶5(NADPH oxidase 5,NOX5)、溶菌酶(lysozyme C)等。本文选择以上与免疫相关的8种蛋白,包括四种上调蛋白(cathepsin L、hemocytin、peroxiredoxin 1和NADPH oxidase 5)和四种下调蛋白(LGBP、ferritin2、Kazal-type protease inhibitor和VEGFR1),利用实时定量PCR检测这8种蛋白在基因水平上的变化,实验结果与TMT筛选结果保持一致。2.EsVEGFR1和EsVEGFR2基因克隆、信息学分析、组织表达和功能研究通过RACE技术扩增了中华绒螯蟹VEGFR基因的两个亚型EsVEGFR1和EsVEGFR2,EsVEGFR1 c DNA序列全长6470 bp,包含一个4380 bp的开放阅读框,编码1459个氨基酸的多肽,SMART网站预测EsVEGFR1蛋白的第802到第1261个氨基酸残基为一个Tyr Kc结构域。EsVEGFR2 c DNA序列全长5548bp,包含一个4704 bp的开放阅读框,编码1567个氨基酸的多肽,SMART网站预测第864到1259个氨基酸残基为一个Tyr Kc结构域。EsVEGFR的序列分析发现其蛋白序列与一些水生甲壳类的VEGFR的序列相似性达到99%,而与昆虫类以及其他无脊椎生物VEGFR序列的相似性也有60-80%。EsVEGFR1在神经组织中表达量最高,其他组织较少;EsVEGFR2在血淋巴细胞中表达量最高,其次是鳃,其他组织较少。中华绒螯蟹螺原体感染后EsVEGFR1在血淋巴细胞中的表达量在第1天下降,第3天和第5天有上升趋势,而后又呈现下调趋势。EsVEGFR2在第1天上升,第3天和第5天表达量下降,而后呈现上调趋势,说明EsVEGFR1和EsVEGFR2在螺原体侵染过程中起着重要的相互调节作用,这为进一步研究EsVEGFR的免疫功能奠定了基础。3.RNA干扰技术研究EsVEGFR1的功能利用人工转录合成的dsRNA将EsVEGFR1基因沉默,在注射dsRNA后使用qRT-PCR技术检测干扰效率,结果显示注射了EsVEGFR1特异性的dsRNA后该基因的转录水平与对照组(PBS、ds GFP)相比显著降低,这证明EsVEGFR1特异性dsRNA可显著降低血淋巴细胞中EsVEGFR1的转录水平。dsRNA将EsVEGFR1基因成功沉默后再用螺原体侵染中华绒螯蟹,结果显示血淋巴细胞中的螺原体拷贝数与对照组相比显著增多,同时中华绒螯蟹的死亡率与对照组(PBS+S.eriocheiris)相比,ds EsVEGFR1+S.eriocheiris组中中华绒螯蟹从第7 d开始死亡并且死亡率增加。这进一步说明沉默EsVEGFR1后降低了中华绒螯蟹的免疫力,促进了中华绒螯蟹螺原体对中华绒螯蟹的感染。总之,这些实验结果为更加深入了解中华绒螯蟹螺原体侵染中华绒螯蟹的机制奠定了一些理论基础,并且为实际应用中生产防治该病害的药物等提供一定的参考价值。
其他文献
现代战争中,电子战占据了极其重要的位置,且已经成为继陆、海、空、天之外的第五维作战空间。随着空间电磁环境的日益复杂,电子侦察测向面临严重的欠定信源估计问题。相较于阵元的均匀线阵,稀疏阵列具有自由度更高和孔径更大的特点,这使得在降低系统复杂度的同时大大提高了系统的测向性能。然而大多数稀疏阵列都具有一定的局限性,其差分阵列往往存在一定的孔,严重限制了阵列的测向性能。为进一步提高稀疏阵列的测向性能,本文
当今世界越来越重视能力与专业的培养,教师是一个专业性极强的的岗位,需要其具备专业实践能力。美国的教师教育机构认证制度有了新的突破,从认证重点上看,美国专业认证标准将更加重视师范专业的临床实践及临床伙伴关系,更加关注实践导向的认证,并且重视大学与伙伴关系的教育实习合作。合作视角下的教育实习在形式、参与方等方面较为多样化,职前教师实习的内容、流程和评价由合作的双方共同协商决定。教育实习合作要确保理论与
随着互相网的发展,网络数据呈现爆炸式的增长,因此知识图谱的不完整性成为制约其被广泛应用于智能搜索、智能问答、个性化推荐等领域的主要问题。而实体预测作为知识图谱补全的重要组成部分成为近年来知识图谱的研究热点。本文在现有研究的基础上,结合旅游领域实体较多、关系比较明显的特点,以实体链接为入手点,进行了面向旅游领域的实体预测方法的研究工作。主要完成了以下研究工作:(1)基于关系指数和表示学习的旅游领域集
近几年来,通信和传感器技术的快速发展,形成了比之前更加广泛的无线传感网络。网络规模的扩大以及节点传输、转发任务量加重都对无线传感网络中节点的计算能力和安全传输提出了新的要求。一方面,由于无线传感网络依靠电磁波作为传输介质,导致无线传感网络是一个开放的不安全网络,传输中需要将明文加密。另一方面,目前大部分加密算法没有考虑到计算资源的消耗,尤其是图像加密领域,多次的迭代操作对计算资源极大。因此,需要设
随着国家技术创新战略的部署,区块链技术逐步与传统互联网深度融合,区块链相关产业得到大力发展。其中,基于区块链技术的全分布式自治系统可以打破异构系统间的数据孤岛,对数
第五代移动通信技术和移动边缘计算是一种能够为车联网提供海量数据传输与时延敏感型任务处理的关键技术。在网络带宽资源与服务器计算资源均有限的车联网中,借助车辆分簇机
无线电监测是监管国家频谱资源的重要手段,通过实时监控频谱使用状态,监管人员可以更优规划频谱资源、有效管理频谱使用秩序。随着无线电监测的网格化发展趋势,无线电监测面临由大量监测节点带来的海量监测数据的挑战。针对海量数据,知识图谱可以用于提取其中的关键信息,构建结构化的知识拓扑结构,进而减少冗余信息存储。本文主要研究无线电监测数据中的知识结构以及构建无线电监测数据的知识图谱。论文的主要研究成果如下:1
对于高速发展的现今人类社会而言,由于石化资源的短缺与化学品需求量的增大,人类急需一种新型资源代替石化资源来生产化学品和液体燃料。生物质作为一种可再生的、廉价易得的唯一有机碳资源,是一种相当具有潜力的可持续资源。因此将生物质原料转化为燃料与高附加值化学品,是当前可持续化学领域研究的热点。其中,在一系列以生物质为原料合成的化合物中,绝大多数为含氧化合物;相比之下,含氮化合物在医药、高聚物纤维、染料、农
车辆跟踪算法是目标跟踪领域的一个分支,它将跟踪对象限定为车辆。其实现形式是使用计算机视觉技术,在一段视频或图像序列中,将相同的车辆连接成轨迹。以此为基础的应用有获得车辆行驶速度、检测交通事故的发生,追踪嫌疑车辆等。因此,车辆跟踪技术在智能交通、智慧城市、人机交互等多个领域有着广泛的应用价值。目标跟踪领域的研究已取得了一定成就,然而,相互遮挡、光照变化、角度变化、远距离目标等因素仍影响着算法的效果。
随着经济全球化以及区域经济一体化的不断推进,地区之间的竞争持续加剧,城市作为相对独立的经济体,其所面临的竞争压力也是与日俱增,在这种背景之下,城市发展中如何发挥自身