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目的:研究肝癌高发地区广西扶绥县肝癌高危人群中HBV DNA S区、X区碱基突变情况,探讨该地区HBV DNA S区、X区突变及其动态变化与肝癌发生的关系。方法:从来自于扶绥县的HBV阳性队列收集30例肝癌病人肝癌确诊年份血清作为病例组,并在队列中按配对条件收集30例未发生肝癌的HBV阳性者同年份血清为对照组,进行1:1匹配,用于配对病例对照研究;在收集到的病例组和对照组的基础上,再收集两组研究对象2011~2015年间确诊前的血清,用于观察突变动态变化及纵向对比研究;提取DNA后利用巢式PCR方法扩增出HBV S基因、X基因片段,对产物进行测序分析。结果：使用Mutation Surveyor V4.0.5软件进行基因分析,寻找突变位点,实验数据使用SPSS16.0统计软件进行相关的统计学分析。结果:1.配对病例对照研究分析结果显示,病例组和对照组HBV S区基因突变率相差较大的位点有G139A、T140A、T140C、C158T、T300C、G620A,经SPSS16.0进行配对卡方检验分析结果显示T140A、T140C、T300C、G620A这4个位点差异有统计学意义(P<0.05);两组HBV X区基因突变率相差较大的有G1721A、T1724C、T1753C,经配对卡方检验分析结果显示这三个位点的差异均有统计学意义(P<0.05);BCP区研究热点A1762T/G1764A双突变在病例组和对照组都有较高的突变率(86.67%和70%),但两组之间差异没有统计学意义(P>0.05);对单因素分析中P<0.05的突变位点纳入条件logistic回归进行相对危险度分析,结果显示T140C和T300C两个位点P<0.05,T140C突变的OR值为0.484,能降低肝癌发生的风险;T300C突变的OR值为2.911,能增加肝癌发生的风险。2.基因突变动态观察及纵向对比分析结果显示,HBV各基因突变位点均在较早年份已发生突变,突变后大部分都保持为稳定的突变体,只有3例研究对象分别在T140C、G1721A、T1753C三个位点中出现回复突变,T140C和G1721A回复突变出现于病例组中,T1753C出现于对照组中,并且回复突变后保持为稳定的野生型;配对病例对照研究中A1762T/G1764A双突变在病例组和对照组的比较中差异没有统计学意义,但长期持续突变对比结果显示,两组之间比较结果显示差别有统计学意义(P<0.05)。结论:1.HBV S区基因突变和HBV X区基因突变与肝癌的发生有密切关系,一些HBV基因突变提高其致癌作用,而也有一些HBV基因突变降低其致癌作用。2.HBV S区基因和HBV X区基因在肝癌诊断前3-5年已出现突变,突变后能保持稳定的突变体,回复突变的出现率较低;A1762T/G1764A双突变的长期持续突变对比结果提示该双突变与肝癌的发展进程存在相关性,也许能应用于高危人群发病的预防。