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目的:探索肾透明细胞癌(Clear cell renal cell carcinoma,ccRCC)发生发展的关键基因、分子标志物及潜在的治疗药物。方法:从GEO(Gene Expression Omnibus)数据库下载基因芯片数据集GSE68417,利用在线分析工具GEO2R基因差异表达分析,并从TCGA(The Cancer Genome Atlas)数据库下载ccRCC的mRNA表达数据及临床数据,利用R软件edgeR包分析获得差异表达基因;通过Veen运算取得2个数据集差异基因的交集,利用注释数据库、可视化数据库、集成发现数据库对差异基因进行GO/KEGG(Gene Ontology/Kyoto Encyclopedia of genes and Genomes)富集分析,进而来探索差异基因的相关分子通路,再利用STRING数据库和Cytoscape 3.7.2软件MCODE插件分析获得蛋白互作网络及关键基因;分析关键基因与生存的相关性后,使用Oncomine数据库及The Human Atlas数据库进行了预后相关的关键基因在mRNA及蛋白层面的表达差异验证;最后使用CMap数据库探索潜在的ccRCC治疗药物。结果:共获得了498个DEGs(Differentially Expressed Genes),其中369个上调,129个下调。差异基因主要富集于细胞因子-细胞因子-受体相互作用、信号路径、药物代谢、细胞粘附分子和糖酵解等。此外,还筛选出8个与ccRCC相关的关键基因,包括EHF、ATP6V1C2、GPD1L、DAO、FCER1G、C1QA、FCGR2B和SLC30A2,这些基因存在显著差异且与预后相关。最后还筛选出布诺洛尔、苯溴马隆和吲哚布洛芬3个潜在的ccRCC治疗药物。结论:综上所述,EHF、ATP6V1C2、GPD1L、DAO、FCER1G、C1QA、FCGR2B和SLC30A2可能是ccRCC进展的驱动基因。更重要的是,它们可能是诊断和指导ccRCC治疗策略的新的生物标记物。另外,布诺洛尔、苯溴马隆和吲哚布洛芬可能是治疗ccRCC的潜在药物。目的:本研究旨在利用TCGA数据库评估关键基因代表EHF(Ets homologous factor)在肾透明细胞癌(Clear cell renal cell carcinoma,cc RCC)中的表达水平,分析其在cc RCC发生发展中的作用及其EHF的低表达对cc RCC患者预后的影响,进而通过本研究来进一步验证第一部分的研究结果。方法:基于第一部分的研究结果,挑选出其中的一个关键基因EHF,评估它在肾透明细胞癌和正常组织中的表达差异水平,使用Oncomine数据库及The Human Atlas数据库对EHF基因在m RNA及蛋白层面的表达差异进行验证;最后采用实时定量聚合酶链反应(q RT-PCR)和免疫印迹试验(Wb)检测EHF及其蛋白的表达水平。通过Pearson秩和检验来分析EHF与其他关键基因之间的相关性。采用方差分析和logistic回归分析EHF与患者临床病理特征的关系。采用Kaplan-Meier法和Cox比例危险模型评估EHF与总生存率的关系。结果:从TCGA数据库中共获得70个癌旁和541个cc RCC组织。结果表明,EHF在cc RCC(60.62±22.07)低于相邻的肾组织(257.40±66.81)(p<0.001),cc RCC的EHF表达的AUC为0.674(p<0.001),EHF的表达在OS和DFS中分别为(p=0.027)和(p=0.497)。q RT-PCR结果显示cc RCC组织中的表达低于正常组织(p=0.045),Wb提示cc RCC中的蛋白表达量有明显低于正常的趋势。EHF基因与第一部分得到的其他关键基因Pearson检验发现,只有5个与其具有相关性:ATP6V1C2(r=0.587,p<0.001)、GPD1L(r=0.387,p<0.001)和SLC30A2(r=0.232,p<0.001)与EHF呈正相关,而DAOA(r=-0.265,p<0.001)和FCGR2B(r=-0.238,p<0.001)与EHF呈负相关。EHF表达降低与T分期(p=0.02)、淋巴结状态(p<0.001)、临床分期(p<0.001)、分级(p<0.001)。Kaplan-Meier生存分析显示EHF低表达与高表达相比预后较差(p<0.001),单变量和多变量COX分析显示EHF是cc RCC的独立预后因素。结论:研究结果表明,EHF在ccRCC中表达量显著降低,在筛选出的关键基因中,ATP6V1C2、GPD1L和SLC30A2与EHF呈正相关,而DAOA和FCGR2B与EHF呈负相关,EHF的表达程度与T分期、淋巴结状态和临床分期分级明显相关,EHF可能是cc RCC潜在的预后标志物。