多个冠心病易感基因的基因多态性和DNA甲基化研究

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目的:本次研究是通过荟萃分析及对宁波地区汉族人群进行候选基因多态性位点的检测,探讨这些多态性位点与冠心病的相关性;通过对易感基因的DNA甲基化分析,探究DNA甲基化变化与冠心病的关系。方法:运用Revman5.0软件对HFE和APOA5基因的多个多态性位点进行荟萃分析;收集经冠脉造影判断的290名冠心病人、198例非冠心病对照以及331例健康对照组人员,采用MassARRAY飞行时间质谱技术对20个候选的基因多态性位点进行检测;挑选年龄、性别、临床指标都相近的冠心病组和对照组各36名(18名男性、18名女性),采用焦磷酸测序方法对PLA2G7、CDKN2B、GCK基因的CpG岛进行DNA甲基化检测。结果:(1)荟萃分析:在欧洲人群中,rs662799-G能增加77%的患病风险(P<0.00001, OR=1.77,95%CI=1.42-2.20),在亚洲人群中能增加38%的患病风险(P <0.00001, OR=1.38,95%CI=1.25-1.52)。在高加索人群中rs1799945-G能增加6%患冠心病的风险(P=0.02, OR=1.06,95%CI=1.01-1.11)。但在中国人群中没有风险性(P=0.77, OR=0.91,95%CI=0.50-1.68)。(2)病例对照研究:Rs7756935-C对冠心病的形成有保护作用(P=0.03, OR (95%CI)=0.68(0.48-0.97)),而rs964184-G (P=0.04, OR (95%CI)=1.40(1.01-1.93))和rs662799-G (P=0.03, OR (95%CI)=1.42(1.04-1.95))增加了冠心病的患病风险。在男性中,rs7528419(CELSR2)突变是冠心病的保护因素,女性中,rs964184(ZNF259)和rs662799(APOA5)突变是风险因素,位于PLA2G7的两个SNP (rs7756935和rs1805017)的突变均起保护作用。(3) TRIB1基因rs17321515多态性与冠心病无关。在CHD患者组,AA基因型携带者的甘油三酯(triglyceride,TG)水平(1.76±1.04)比AG基因型携带者的TG水平(2.09±1.07)低(P <0.05),而其低密度脂蛋白(low density lipoprotein,LDL)水平(2.52±1.48)明显比携带AG基因型的患者(2.14±1.08)的LDL水平高(P <0.05)。而在非CHD对照组,AA携带者(2.22±1.14)、AG携带者(2.03±1.09)的TG水平均要比GG携带者(1.68±1.03)显著高(P <0.05)。(4) ABCG5/ABCG8的rs4299376多态性与冠心病无关。在女性中,冠心病患者的TG及总胆固醇(TC)水平比非冠心病对照的明显高(CHD组TG:2.23±1.05,非CHD组TG:1.84±1.03,P=0.01; CHD组TC:4.79±1.17,非CHD组TC:4.36±1.03,P=0.01)。将年龄进行分组后,在≥60岁的分组中,冠心病患者的高密度脂蛋白(HDL)水平比非冠心病对照低(CHD组:1.09±0.23,非CHD组:1.16±0.25,P=0.03)。(5) CHD组PLA2G7基因的甲基化水平比对照组高(6.41±2.62vs4.98±3.06,P=0.026),在性别中差异没有统计学意义(P=0.226)。男性的CDKN2B甲基化水平比女性要高(8.07±2.76vs6.02±2.26,P=0.007),且CHD组和对照组相比也有较高的CDKN2B甲基化水平(7.66±3.02vs6.43±2.23,P=0.043)。而GCK基因CpG2-4及平均甲基化水平在CHD组中都比对照组中低,且都有统计学意义(P<0.05)。PLA2G7和CDKN2B在病例对照比较时发现女性中有较显著的统计学差异(P=0.003,0.009)。女性中病例组的甲基化水平要比对照组高,而男性中差异不大。(6) PLA2G7和CDKN2B的甲基化水平在男性中与年龄呈负相关关系(PLA2G7: r=-0.365, P=0.037;CDKN2B: r=-0.370, P=0.034),而女性中与年龄呈正相关关系(PLA2G7: r=0.373, P=0.035; CDKN2B: r=0.406, P=0.021)。GCK基因的甲基化水平与年龄没有关系(P>0.05)。对年龄按照60岁为界进行分组,发现在60岁以下人群中,甲基化程度与男女均没有显著相关性(P>0.05),但是在60岁以上人群中,女性的甲基化程度与年龄有显著相关性(PLA2G7:r=0.437, P=0.033; CDKN2B:r=0.579, P=0.007)。而男性60岁以上人群中,仅PLA2G7的甲基化程度与年龄有显著相关性(PLA2G7:r=-0.509, P=0.013)。结论:(1)荟萃分析:rs662799(APOA5)突变是冠心病的易感基因位点。rs1799945(HFE)突变在高加索人群中是冠心病的风险因素,但在中国人群中没有风险性。研究基因多态性位点与冠心病的关系的荟萃分析已发表于Molecular Medicine Reports (IF=1.17)及Gene (IF=2.2)。(2)病例对照研究:在男性中,rs7528419(CELSR2)突变是冠心病的保护因素,女性中,rs964184(ZNF259)和rs662799(APOA5)突变是风险因素,位于PLA2G7的两个SNP (rs7756935和rs1805017)的突变均起保护作用。该病例对照研究的实验结果已发表于Experimental and therapeutic medicine (IF=0.34).(3) TRIB1基因rs17321515多态性与冠心病无显著相关性。在CHD患者组,携带AA基因型的患者具有较低的TG水平和较高的LDL水平,非CHD组携带A等位基因的对照者TG水平较高。ABCG5/ABCG8基因rs4299376多态性与冠心病无关。冠心病组的女性比非冠心病组的女性具有更高的TC和TG水平。60岁以上的冠心病患者比非冠心病患者具有较低的HDL水平。基因多态性与脂质水平的研究结果一项已发表于《中国科技论文在线精品论文》,另一篇文章已被《第二军医大学学报》接收。(4) PLA2G7和CDKN2B启动子区的高甲基化会增加冠心病的风险。男性的CDKN2B甲基化水平比女性要高。而GCK基因的甲基化水平在CHD组中比对照组中低。PLA2G7和CDKN2B在分性别病例对照比较时发现两个基因在女性中均有较显著的统计学差异。(5) PLA2G7和CDKN2B的甲基化水平在男性中与年龄呈负相关,而女性中呈正相关。在60岁以上人群中,女性的甲基化程度与年龄有显著正相关性,男性仅PLA2G7的甲基化程度与年龄有显著负相关性。关于DNA甲基化与冠心病关系的研究中,文章已发表于PlosOne (IF=3.73)及BioMed ResearchInternational (journal of biomedicine and biotechnology, IF=2.88)。另有一篇在准备投稿中。
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