当今的世界正处在一个相互依存、相互渗透、联系紧密、交流频繁的时代。要素流动，经济跨国，贸易往来，科研合作，技术转移，政治对话，文化融合，各个领域、各个方面都表现出集聚整合的大趋势。经济全球化是这个大趋势中一个主要的、显著的表现形式，对其它趋势产生着重大影响。随着经济全球化的不断推进以及科技的不断进步，创新的范式也开始从线性模式向网络模式转变。这样的转变已经深刻的影响到了制药产业的创新活动，特别是20世纪70年代以来，现代生物技术被应用到新药研发之后，全球制药产业价值链参与者之间关系的网络化趋势变得更加明显。随着世界各国人民生活水平的不断提高，人们对生活质量的要求越来越高以及制药产业巨大的市场和高利润，制药产业目前已成为世界各国争相发展的重点产业领域。制药产业作为一个典型的技术驱动型产业，创新具有更为重要的意义。目前，我国药物开发主要还处于低水平复制和仿制阶段，制药产业创新水平仍然落后。与此同时，由于看好中国医药市场的发展潜力以及廉价的医药创新资源，外资研发开始大举进入我国，对我国的“本土研发”造成了非常大的冲击。如何推动我国制药产业从这种内外交困的境地中实现突破，提高制药产业的创新水平，提升制药产业的竞争力，成为一个亟待解决的问题。长江三角洲地区是我国制药产业最大的聚集区，该区域内已出现了若干初级阶段的制药产业集群。本文从制药产业集群协同创新的角度出发，以长三角地区制药产业集群为出发点，探索如何促进目前在国内相对较为发达的长三角地区制药产业率先实现形成成熟的制药产业集群，并通过相关举措推动长三角地区制药产业集群间的协同创新，以提高该地区制药产业的创新水平，进而带动我国整个制药产业创新能力的升级。本文共分8章。第1章为绪论，重点介绍了本文的研究背景、意义以及相关的研究方法、研究框架及主要内容。第2章为相关理论的梳理。第3章是对产业集群协同创新的博弈分析，运用博弈论方法建立了产业集群协同创新的博弈模型，对产业集群协同创新过程中的相关环节进行了博弈分析。第4章则运用网络组织理论探讨了产业集群协同创新的机制以及实现产业集群协同创新的理论路径。第5章分析了制药产业研发特征以及制药产业全球价值链的变动，以及全球及我国制药产业的发展态势等制药产业的相关产业背景。在此基础上，在第6章，对长三角制药产业发展的SWOT分析，初步形成了长三角地区制药产业协同创新水平分析的思路，然后运用社会网络分析软件Ucinet对长三角大型制药企业的分支机构网络以及创新活动网络进行了分析，并提出了目前长三角地区制药产业集群协同创新中存在的问题。第7章在前面各章分析的基础上，提出了推进长三角制药产业集群协同创新的若干对策建议。第8章为本文的基本结论及对未来进一步进行研究的展望。