中国樱桃(Cerasus pseudocerasus Lindl.),俗称小樱桃,起源于我国,隶属蔷薇科(Rosaceae)李亚科(Prunoideae)樱属(Cerasus),其栽培历史已达3000余年之久,是我国最为重要和古老的栽培果树之一,广泛分布于我国各地。栽培中国樱桃具有树姿秀丽,花朵清香、果实璀璨晶莹、无农药污染等特点,因而深受消费者喜爱。近年来,随着我国人们生活水平的提高,对生活质量有了更进一步需求,乡村旅游、农家乐蓬勃兴起,使得中国樱桃的观赏性、早熟性(2-3月开花,4-5月成熟)、安全性(适应性、抗病性强)三大特点得以充分展现,中国樱桃产业的发展具有广阔的前景。然而,发展产业,种质是关键。中国樱桃栽培资源,主要包括栽培品种和地方种质,是对中国樱桃现有栽培品种进行推广栽培及品种改良的最重要材料。然而,目前对中国樱桃资源的利用和保护重视不够,导致许多资源已流失。此外,由于以往的研究中样本的大小、代表性及方法的局限性,使得对中国樱桃栽培资源的遗传多样性和群体遗传结构的研究尚未得到准确、有效的数据。基于此,本文收集了在全国具有代表性的中国樱桃栽培区域的资源137份,包括12个地方种质群体,并利用共显性分子标记SSR对其进行研究,评价了中国樱桃栽培资源的遗传多样性及群体遗传结构。主要研究结果如下：(1)中国樱桃栽培资源的遗传多样性研究20对引物在137份中国樱桃栽培资源中共检测到126个等位基因,每个位点的平均等位基因数目(NA)为6.3,各多态性指标(HO=0.5321,HE=0.6368,H=0.6241,I=1.2198)均表明本研究所用SSR位点具有较高的多态性,同时也表明栽培资源具有丰富的遗传多样性。12个中国樱桃地方种质群体的平均等位基因数目(Na)为1.90-4.20,各群体的多态性位点百分率(PPL)均较高,为70%-100%。各群体的各多态性指标平均值(HO=0.524,HE=0.5105,H=0.471,I=0.799,GI=0.696,GD=0.375)均表明12个群体遗传多样性较高。我们认为其可能原因有如下三点：一是中国樱桃分布广泛,属于典型的广布种,广布种一般具有丰富的遗传多样性；二是中国樱桃栽培资源主要依靠人类活动和动物取食果实后的种子来传播,传播能力较强；三是本研究中的中国樱桃栽培资源可能来自于两个基因库。FIS代表群体偏离Hardy-Weinberg平衡的程度,整个中国樱桃地方种质群体的平均FIS值为-0.058,表明在总体水平上,中国樱桃地方种质群体表现为杂合子不足现象,而在部分群体内,则表现为杂合子过剩的现象。所有位点的卡平方检测和似然比率检测都达到了极显著水平,表明在群体水平上每个位点都极显著的偏离Hardy-Weinberg平衡。(2)中国樱桃地方种质的群体遗传结构研究Structure和PCA分析均表明,本研究中的中国樱桃地方种质可能来自于两个不同的基因库,其中四川的各群体(YC、DL、XC、SM、BC)和重庆涪陵群体(FL)主要以一个基因库为主,而陕西商南群体(SN)、陕西西乡群体(XX)、贵州贵阳群体(GY)、贵州毕节群体(BJ)、甘肃天水群体(TS)和山东潍坊群体(WF)主要以另一基因库为主。聚类分析也得到了类似的结果。与其它分子标记在樱属植物中的研究相似,中国樱桃群体的遗传分化较低(GST=0.170,凡T=0.171,RST=0.159),没有显著的群体遗传结构。中国樱桃地方种质群体总的遗传多样性(HT)为0.615,其中群体内遗传多样性指数(Hs)为0.511,群体间遗传多样性(DST)为0.104,AMOVA分析显示中国樱桃地方种质群体间变异为10.33%,大部分变异来自于群体内80.67%。群体间基因流(Nm=0.722)较低,本研究中12个群体为栽培群体,据此我们推测：以果实为生的动物的长距离种子传播能力、较长的世代周期,以及人为传播可能是这些群体间基因交流的主要方式。Mantel检测显示群体间的遗传距离与地理距离间没有显著相关性(r=-0.0019,P=0.41),表明中国樱桃地方种质群体间的遗传变异不是由于地理隔离造成的。针对目前中国樱桃栽培资源的现状和本文研究结果,建议资源的保护以就地保存为主,配合迁地保护(种质资源圃)和建立种子基因库。尤其注意保护有较高遗传多样性水平,且来自不同的基因库的群体,如：四川石棉(SM)、四川西昌(XC)、四川北川f(BC)、贵州毕节(BJ)、甘肃天水(TS)和山东潍坊(WF)等群体。