通过生物信息学方法探索HBV相关性肝细胞癌的关键基因

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目的:HBV相关性HCC为我国主要的原发性肝癌类型,其在我国的发病率及致死率均居世界范围内榜首,但慢性HBV感染进展为HCC的分子机制仍未完全明确,该研究旨在鉴定与HCC相关的关键基因。方法:通过对多个基因表达谱数据集进行综合分析,筛选肝细胞癌和癌旁肝组织样品之间差异表达的基因。通过蛋白质-蛋白质相互作用网络、GO和KEGG富集等分析,确定了可能与肝细胞癌的发病机制、诊断和预后有关的生物标志物。结果:我们鉴定了 2个基因模块:包含11个上调关键基因MCODE1和10个下调的关键基因MCODE2,MCODE1包含CCNB1、CCNB2、CDC20、MAD2L1、BUB1B、NUF2、ZWINT、BUB1、BIRC5、CENPF、CENPK;MCODE2 包含以下基因:CYP3A4、CYP1A2、CYP2E1、CYP2C8、CYP2C9、CYP2C19、CYP3A43、CYP26A1、CYP2B6、CYP39A1,这些基因可能与HCC的发病机理密切相关,通过生存分析发现CCNB1、CDC20、MAD2L1、ZWINT、BIRC5、CYP2E1、CYP1A2、CYP2C8、CYP2C9、CYP2C19可能作为HCC患者预后生物标志物。CCNB1、CDC20、MAD2L1、CYP1A2、CYP2C8、CYP2C9、CYP2C19 在 HCC 组织与癌旁组织基因表达差异与免疫组化特征具有一致性,将有望成为HCC的病理诊断标志物。结论:通过综合生物信息学研究发现肝细胞周期、有丝分裂过程、多种物质代谢失衡可能在HBV相关性肝细胞癌的发生发展中起重要作用。CCNB1、CDC20、MAD2L1、CYP1A2、CYP2C8、CYP2C9、CYP2C19将有望成为HCC的诊断、预后预测和分子靶向治疗的生物学标志物。
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