端粒DNA四重折叠结构的检测及其动力学性质的研究

来源 :武汉大学 | 被引量 : 2次 | 上传用户:yuantxunda
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DNA和RNA可以通过分子内的相互作用而自身折叠起来形成二级结构,这些二级结构的形成和稳定对于参与和行使一定的生物学功能具有非常重要的意义。由于在体内所具有的潜在功能,它们被认为是治疗癌症及其它疾病的药物治疗靶点。人的端粒DNA包含重复序列(TAAGGG)4组成的G链和(CCCTAA)4组成的C链。G链可以通过碱基G之间的氢键相互作用形成四重折叠结构,C链也可以通过质子化的C+和C相互作用形成四重折叠结构。由于线性DNA的末端复制问题,细胞在分裂时无法完整复制端粒末端而造成端粒丢失。端粒酶以伸展的G链为底物,将其延长,G链一旦形成四重折叠结构端粒酶就无法识别底物,其活性受到抑制。因此,以四重折叠为靶点,寻找能够和其作用并使这种结构稳定的药物分子,迅速成了肿瘤治疗领域的一个新的希望。 芯片技术的发展为药物的筛选提供了一个强有力的工具。但是,要寻找和二级结构作用的分子,首先需要确定固定在芯片上的DNA是否形成了二级结构以及二级结构在芯片上的稳定性。 本文利用Biacore技术,以端粒序列为材料,对其固定在芯片上后的特性进行了定性和定量两方面的研究,获得了以下主要结果: 一)单链结合蛋白检测四重折叠结构的形成 1.通过紫外交联,PAGE分离纯化,我们获得了单纯的四重折叠结构。凝胶迁移实验表明,单链结合蛋白不和四重折叠结构结合,而只能使单链伸展状态的DNA发生迁移。这一结果为我们后面的研究奠定了基础。而且,基于此性质,单链结合蛋白可以作为一个通用的探针来检测二级结构。 2.(TAAGGG)4的电泳实验表明,K+条件下,它的迁移率明显的比相同长度的单链DNA和双链DNA都要快,说明它在K+条件下形成了二级结构。(TAAGGG)4的熔解实验表明,与Li+相比,Na+和K+的存在都使G链随温度的升高出现了一个明显的相变过程,而且K+的相变出现在更高的温度。这些实验说明,在溶液状态下,Na+和K+都可以促进G链形成二级结构,而且K+促进作用更强。 3.用单链结合蛋白检测固定在芯片上的DNA时发现,与Li+相比,K+对SSB和随机链的结合有微弱的促进作用;但是,对SSB和(TAAGGG)4的结合却有很强的抑制作用。我们的研究证明了,这种抑制作用是由G链在芯片上形成了二级结构而引起的。
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