丙型肝炎病毒基因组3′非编码区与细胞蛋白U2B作用的研究

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本研究首先应用T7噬菌体展示库技术,以HCV3NCR为诱饵筛检T7噬菌体人肝细胞文库,寻找与HCV3NCR相互作用并参与HCV基因复制的细胞蛋白。首先体外转录了来自HCV基因组全长的3NCR,使之与生物素标记的寡聚DNA退火结合,经过三轮的重复筛选,最终获得5个细胞蛋白,分别为剪接因子U2B、线粒体上的NADH脱氢酶亚单位3、细胞色素c氧化酶亚基Ⅱ、细胞色素P450超家族成员及一种功能未知的蛋白。   基于RNA剪接因子可能与HCV3NCR相互作用、调节HCV复制的推测,本研究进一步探讨了剪接因子U2B蛋白在HCV基因复制中的作用。通过构建了针对U2B蛋白的RNA干扰重组质粒,发现可特异、有效地抑制HCV亚基因组复制子细胞中内源性U2B蛋白的表达。进一步通过定量RT-PCR和WesternBlot分别检测U2B表达抑制后复制子细胞中HCV复制、翻译的改变,发现HCV亚基因组复制子细胞中内源性U2B蛋白的表达被抑制后,该细胞中HCV亚基因组的病毒RNA和蛋白质水平反而比对照组有显著增加,提示U2B参与调节HCV的复制且对HCV的复制、翻译有负调控作用。   为了验证核蛋白U2B在HCV复制子细胞中能定位于HCV复制发生的胞浆,进一步分离了复制子细胞的各亚细胞组分(包括HCV复制复合体所在的脂筏结构),通过WesternBlot发现在HCV复制子细胞的胞浆及脂筏结构中均有U2B的分布,说明U2B蛋白可以参与到HCV的复制过程,推测其可能是HCV复制复合体的组分之一。   综上所述,本研究应用T7噬菌体展示库技术对T7噬菌体人肝细胞文库进行了筛选,获得5种可能与HCV3NCR相互作用的细胞蛋白,包括U2B等。通过RNA干扰技术发现U2B蛋白对HCV的复制、翻译有负调控作用;进一步研究发现核蛋白U2B可以分布于含有HCV复制复合体成分的的胞浆及脂筏结构中。
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