【摘 要】
：
目的:乳腺癌在全球女性人群中高发,被认为是影响女性日常生活及生理、心理健康的重要因素。数年来,乳腺癌的确诊人数及死亡人数持续上涨,成为女性最主要的致死因素。淋巴结转移的患者普遍预后较差,然而,能够有效预测乳腺癌预后且与淋巴结转移相关的联合基因生物标志物尚未见报道。方法:利用TCGA数据库获取981例乳腺癌组织和109例正常乳腺组织的转录组数据及对应的临床数据。使用DESeq2包筛选乳腺癌组织和正常
论文部分内容阅读
目的:乳腺癌在全球女性人群中高发,被认为是影响女性日常生活及生理、心理健康的重要因素。数年来,乳腺癌的确诊人数及死亡人数持续上涨,成为女性最主要的致死因素。淋巴结转移的患者普遍预后较差,然而,能够有效预测乳腺癌预后且与淋巴结转移相关的联合基因生物标志物尚未见报道。方法:利用TCGA数据库获取981例乳腺癌组织和109例正常乳腺组织的转录组数据及对应的临床数据。使用DESeq2包筛选乳腺癌组织和正常乳腺组织、乳腺癌LNM组织和NLNM组织的差异基因。两组上调基因应用韦恩图取交集,随后进行单因素和多因素COX回归分析,建立与乳腺癌独立预后相关的多基因预测模型,计算风险评分。根据风险评分的中位数将981例乳腺癌患者分为低风险组和高风险组,绘制Kaplan-Meier曲线比较两组患者的预后情况,并应用ROC曲线对多基因预测模型进行效果评价。将患者的临床病理特征及多基因风险评分纳入Cox回归分析中,筛选影响乳腺癌预后的相关因素,绘制各因素及其亚组的Kaplan-Meier生存曲线,验证多基因模型在乳腺癌预后中的预测效果。最后通过功能注释和通路富集分析探索这些基因的潜在分子机制和特性。结果:乳腺癌组织和正常乳腺组织共筛选出5023个差异基因,其中上调基因2082个,乳腺癌LNM和NLNM组织共筛选出178个差异基因,其中上调基因47个。两组上调基因取交集,得到39个交叉基因。对39个交叉基因进行单因素和多因素Cox回归分析,筛选出与LNM相关的7个基因（IAPP、LHX1、NDST4、LYZL2、HUS1B、XKR7和PSCA）构建乳腺癌多基因预测模型。按照公式计算风险评分,风险评分=（0.24469×LHX1表达量）+（0.42797×XKR7表达量）+（0.43192×LYZL2表达量）+（0.22742×NDST4表达量）+（0.13228×PSCA表达量）+（0.35249×IAPP表达量）-（0.52426×HUS1B表达量）。根据预后风险评分的中位数,将981例乳腺癌患者分为低风险和高风险组。Kaplan-Meier生存曲线显示高风险组的生存率显著低于低风险组。ROC曲线下面积（AUC）为0.714,表明多基因模型具有良好的预测能力。临床数据Cox回归分析显示年龄、癌肿状态、7基因模型风险评分是乳腺癌患者预后的独立影响因素。Kaplan-Meier生存分析显示多基因预后模型在乳腺癌各亚组（N0、M1、伴瘤除外）患者中均具有较好的预后预测价值。高风险患者的功能注释表明,此风险模型主要与神经活性配体-受体相互作用、类固醇激素生物合成、视黄醇代谢等通路相关。结论:1.与LNM相关的7-基因模型能够较好的预测乳腺癌患者的预后,可作为乳腺癌预后的组合生物标志物。2.该基因模型能够用于淋巴结阳性的中晚期乳腺癌患者预后的预测。
其他文献
目的:胃癌是消化道最常见的恶性肿瘤,致死率较高,研究发现,肿瘤微环境与肿瘤的发生发展密切相关。肿瘤相关巨噬细胞（Tumor-associated macrophage,TAM）是肿瘤微环境的重要组成部分,能促进肿瘤细胞的增殖、诱导上皮间质转化进而促进肿瘤细胞的迁移和侵袭。但TAM与胃癌细胞相互作用调节癌细胞生长的作用及机制尚不清楚。因此,本文主要探讨TAM对胃癌细胞生物学特性的影响及其可能调控机制
目的:总结浆细胞白血病（PCL）患者临床资料,为提高诊疗水平提供理论依据。方法:报道2013年6月至2020年6月期间河北省人民医院收治的6例PCL患者,结合现有文献探讨其临床及实验室特征。结果:1.本组患者中原发性PCL（pPCL）5例、继发性PCL（s PCL）1例;男性2例、女性4例;年龄56-68岁,中位年龄67岁;2.本组患者临床表现有胸闷2例、出血2例、骨痛2例、发热1例、肝大1例、脾
目的:分析探讨Ⅵ型胶原α1（COL6A1）、细胞周期依赖性激酶4（CDK4）在软骨肉瘤组织中表达水平与临床病理特征及预后的相关性。方法:采用回顾性研究,收集河北医科大学第三医院2014年1月—2019年12月进行手术治疗的39例软骨肉瘤病例及相应肿瘤组织蜡块标本,以25例同期入院的骨软骨瘤患者作为对照。采用免疫组织化学法对软骨肉瘤肿瘤组织、骨软骨瘤标本中COL6A1、CDK4表达情况进行检测。统计
第一部分m6A甲基化修饰调控结肠癌细胞中RP11-150O12.3表达的研究目的:通过TCGA数据库筛选结肠癌中m6A相关的差异表达的lncRNA（DElncRNAs）,研究m6A甲基化修饰对RP11-150O12.3在结肠癌表达的影响。方法:1.运用EdgeR包从TCGA数据库中筛选结肠癌与癌旁组织中差异表达的lncRNA,利用Spearman相关分析筛选m6A相关的DElncRNAs（|r|>
目的:本研究采用logistic回归方法,通过回顾性分析乳腺癌化疗患者临床资料,筛选出化疗相关心脏毒性危险因素,构建预后模型,为临床医生评估乳腺癌患者化疗心脏毒性风险提供更有效的工具。方法:回顾性研究分析2016年9月至2020年12月在河北省人民医院收治的已进行完整化疗周期的乳腺癌患者的病历资料。定义心脏毒性判断标准,筛选出纳入研究的影响因子,包括年龄、高血压、糖尿病、冠心病、体重指数、肿瘤分期
目的:评估自牵引食管残胃吻合术在腹腔镜近端胃癌根治术治疗SiewertⅡ、Ⅲ型食管胃结合部腺癌（adenocarcinoma of esophagogastric junction,AEG）、胃底癌中的安全性、可行性。方法:回顾性整理河北省人民医院胃肠外科2018年1月-2020年7月行腹腔镜自牵引食管残胃吻合术病例31例（自牵引组）及传统腹腔镜食管残胃吻合术病例24例（传统组）,对比术前基本情况
目的:本研究旨在通过相关文献研究的荟萃分析,比较FOLFIRINO X和白蛋白结合型紫杉醇联合吉西他滨方案在胰腺癌治疗方面的特点,主要侧重于两种方案在化疗和新辅助化疗方面的疗效和安全性评价,为临床化疗方案选择提供部分参考。方法:我们搜索了PubMed、Cochrane图书馆、EMBASE、Web of Science、中国知网、万方数据资源库、中国生物医学文献数据库等数据库进行检索,检索出从建库至
目的:盆腔炎性疾病是女性上生殖道常见的一组感染性疾病,如诊治不及时,治疗不彻底,可导致炎症的反复发作,而炎症的特征是产生自由基、细胞因子、前列腺素和生长因子,这些可能导致DNA发生遗传和表观遗传变化,导致恶性转化的风险增加[1]。卵巢癌的病因尚无明确定论,但关于盆腔炎与卵巢肿瘤之间的关系的报道较少,且结果相互矛盾,因此,本文将国内外研究盆腔炎与卵巢肿瘤相关性文章进行汇总,进一步研究其相关性。方法:
目的:分析、探讨影响CT引导下放射性125I粒子组织间永久性植入治疗中晚期非小细胞型肺癌（Non-small cell lung cancer,NSCLC）近期疗效的相关因素,评估近期疗效的同时观察粒子植入术后不良反应,以期为中晚期NSCLC患者放射性125I粒子植入术临床诊治工作及预后评价提供参考。方法:系统性回顾了我中心2015年5月-2019年2月42例采用CT方式引导下放射性125I粒子组
目的:初步探讨肠道微生态制剂干预治疗对腹腔镜结直肠癌根治术老年患者围手术期认知功能的影响。方法:选择我院2020年09月至2021年01月在全身麻醉下行腹腔镜结直肠癌根治术的老年患者52例,采用随机数字表法分为常规处理组和微生态制剂组,每组26例。常规处理组患者术前予以常规肠道准备,微生态制剂组于术前5天开始给予肠道微生态制剂干预治疗,并持续至术后第7天。记录两组患者的麻醉时间、术中出血量及术中丙