Sphingomonas sp.YL-JM2C代谢三氯卡班关键基因的功能研究

来源 :上海交通大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:fkjunjin
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
三氯卡班是一种多氯联苯的芳烃化合物,其作为抗菌剂,被广泛应用于人们的生活中。由于三氯卡班稳定性强、难降解,在环境中积累,现已被列为新兴污染物之一而得到人们的重视。目前,有关微生物降解三氯卡班的研究仍在起步阶段。Sphingomonas sp.YL-JM2C是一株可降解三氯卡班的纯培养菌株,已在化学水平上推测其降解三氯卡班的代谢途径,然而在分子生物学、生物化学水平上并无相关研究。本课题在生理学水平上,利用全自动生长曲线测定仪,对三氯卡班降解菌株YL-JM2C的生长特性进行探究,确定该菌株利用三氯卡班生长的最适生长条件:菌株YL-JM2C利用三氯卡班生长的最适浓度为4mg/L-8 mg/L,最适pH值为7.0-7.5;当优化的R2A基本培养基中含有0.01%酵母提取物时,菌株YL-JM2C可更好地利用三氯卡班作为碳源生长。通过高效液相色谱证明菌株YL-JM2C可降解三氯卡班,在10小时内对三氯卡班的降解效率达到68.77%。在三氯卡班下游途径研究中,通过基因组分析找到3个邻苯二酚1,2-双加氧酶基因stcA1、stcA2、stcA3和3个邻苯二酚2,3-双加氧酶基因stcE1、stcE2、stcE3。在大肠杆菌中异源表达上述6个基因,通过检测粗酶液和纯化蛋白的活力和相关酶动力学参数,证明5个蛋白,StcA1、StcA2、StcA3,StcE1和StcE2均可催化邻苯二酚及其衍生物氯代邻苯二酚开环。利用实时定量PCR定量分析邻苯二酚双加氧酶基因的转录表达量,初步推测5个邻苯二酚双加氧酶基因stcA1、stcA2、stcA3、stcE1和stcE2均为组成型表达。在三氯卡班上游代谢途径探究中,通过基因组分析发现5个潜在的酰胺水解酶基因,经过化学显色反应初步判断其可能均编码酰胺水解酶催化三氯卡班的水解反应。本课题在同一菌株中发现5个邻苯二酚双加氧酶基因并确定StcA1、StcA2、StcA3属于II型邻苯二酚1,2-双加氧酶,推测StcE1、StcE2为新型邻苯二酚2,3-双加氧酶;并找到5个潜在的酰胺水解酶基因。本课题研究为深入研究三氯卡班完整代谢途径奠定了基础,并为探究三氯卡班污染环境的微生物修复提供了理论依据。
其他文献
罂粟科(Papaveraceae)博落回属植物(Macleaya R.Br)包括博落回Macleaya cordata(Willd).R.Br和小果博落回Macleaya microcarpa(Maxim.)Fedde。目前已从博落回属植物中发现100余个生物
目前,手性化合物的研究越来越受到关注,其中手性配合物及手性金属-有机框架物具有多变的结构、富含孔道、特殊的配位键环境等优点,在手性拆分、不对称催化、气体吸附分离、化
TLR4作为模式识别受体家族成员,是天然免疫反应中的重要部分,通过识别革兰氏阴性菌细胞壁主要成分脂多糖(LPS),激活下游炎症因子的表达,促使炎症的发生以对抗细菌的入侵。大肠
植保机械可以减轻劳动者的工作负担,在世界范围内广泛应用于大型农作物管理作业中。植保机受复杂田间路面环境、药液晃动以及自身不确定的机械运动状态等因素的影响,在作业过
全球气候变化引起的高温已成为威胁全球作物生产与品质的一大逆境。明确高温对作物产量和品质形成的影响及其原因,对培育作物耐高温新品种、制订抗高温栽培技术措施具有重要
本研究以800名大学生为被试,考察了羞怯对网络成瘾的影响以及作用机制。本研究基于网络成瘾的非适应性认知—行为模型(PIU)建立理论模型,并通过结构方程模型及模型间比较的方
含氟有机物具有显著增强的生理、药理活性,在医药和农药领域应用广泛。目前,在上市的药物中含氟药物占有较大的比重,尤其是含三氟甲基的药物是典型的代表。因此,将三氟甲基引
目的:观察PD-L1分子在临床肝内胆管癌(intrahepatic cholangiocarcinoma ICC)患者组织中的表达;观察并分析PD-L1、IFN-γ、TNF-α、VEGF在ICC小鼠原位模型中的表达;观察PD-L1
在当今社会,高速发展的互联网技术影响着人类生活的各个方面。在这个信息交互频繁的时代,互联网中积累了大量的图像数据。如何有效的组织和利用这些各式各样的图像数据,成为了一个目前亟待解决的问题。这也催生了基于内容的图像识别与检索技术的兴起和发展。随着图像数量的增加,图像检索精度与检索速度面临着巨大的挑战。哈希方法以其高效性与低内存占用在图像检索技术中配受青睐。同时,得益于深度学习技术在计算机视觉领域中的
乙酰辅酶A途径是指以H2作为电子供体,CO2作为电子受体进行生物合成并产生能量的过程。产乙酸菌是一类能通过乙酰辅酶A途径将CO2和H2转变成乙酸的微生物,长期被认为只出现在细