耐辐射奇球菌pprM启动子鉴定及其与PprⅠ蛋白的相互关系研究

来源 :南华大学 | 被引量 : 2次 | 上传用户:loveqin11
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
背景:耐辐射奇球菌(Deinococcus radiodurans,DR)是至今为止发现的一种对电离辐射、紫外线、强氧化剂和化学诱变剂等均具有超强耐受力的极端微生物。Ppr M是在研究耐辐射奇球菌ppr I和ppr A之间的关系时发现的一个新的依赖Ppr I的可能的调节蛋白,并发现ppr M基因缺失菌株对γ辐射的敏感性明显增加。Ppr M是冷激蛋白同源物,其功能尚不完全清楚。有报道称ppr M是非常重要的抗逆基因,但是关于ppr M基因启动子未见报道,其在辐射抗性中的调节或被调节方式并不清楚。ppr I基因被认为是辐射抗性机制的总开关,Ppr I蛋白是一种DNA双链结合蛋白,其功能与电离辐射抗性相关。基于Ppr M对Ppr I蛋白的依赖性,我们推测Ppr I蛋白可能通过结合ppr M的启动子或周围序列来发挥增强ppr M的抗辐射作用。目的:本研究将首先寻找ppr M的启动子,确定启动子功能,再表达和纯化Ppr I蛋白,利用凝胶阻滞实验观察Ppr I蛋白是否与预测的ppr M启动子结合。本实验通过对耐辐射奇球菌ppr M启动子的分析鉴定,以及与Ppr I蛋白相互关系的研究,为ppr M基因在耐辐射球菌抗辐射调控网络中的地位与作用的阐明提供资料。对进一步探索DR菌的极端抗性与DNA修复机制具有重要的理论意义和应用价值。方法:首先运用生物信息学方法预测ppr M的启动子;再构建含有绿色荧光蛋白报告基因的表达载体以确定其是否具有启动子的功能;构建p ET-28a-ppr I重组表达载体并纯化蛋白,然后通过凝胶阻滞实验检测Ppr I蛋白与含有生物素标记的启动子探针是否结合,以确定Ppr I蛋白与ppr M启动子或周围序列的功能关系。结果:运用生物信息学方法预测ppr M的启动子位于DR0904至DR0906之间。构建了含有绿色荧光蛋白报告基因、ppr M基因、ppr M启动子的三联表达载体,证明所预测序列具有启动子的功能。成功表达并纯化出Ppr I蛋白,通过EMSA方法证明Ppr I蛋白与预测的ppr M启动子序列体外实验并没有结合关系。结论:1.生物信息学预测的ppr M基因启动子序列位于DR0907上游2Kbp的位置,核心序列在1号染色体上的具体位置是911977912026。2.预测的ppr M启动子序列对ppr M基因具有启动子功能。3.Ppr I蛋白与ppr M启动子体外没有结合关系。
其他文献
多梳蛋白(Polycomb group protein)是动物和植物在进化过程中形成的一类保守的转录抑制因子,它以蛋白复合体的形式发挥作用。拟南芥中PcG的FIS复合物主要是抑制中央细胞不经
内含子剪接是真核生物基因mRNA成熟过程中必须的一个步骤,也是真核生物基因表达调控过程的一个重要层面,在基因表达中的作用是广泛而深远的。内含子剪接与基因的转录起始和转
目的研究蛋白激酶Wee1在小鼠1-细胞期受精卵各个细胞时期的表达水平,应用酵母双杂交技术筛选出与Wee1蛋白激酶相互作用的候选分子,进而验证转录因子jun B与蛋白激酶Wee1的相
营养盐是浮游植物生长繁殖最基础的营养物质,水体浓度过高或过低都不利于浮游植物的正常生长。浮游植物生长限制性元素研究尤其是氮磷营养盐对浮游植物的限制影响逐渐成为海
从上世纪90年代开始,美国、德国等西方国家以及日本、韩国等亚洲国家,机械化、自动化的设备发展迅速,焊接机器人等高效焊接技术在造船企业开始得到应用。2000年以后,造船行业
中国科学院空间科学与应用研究中心研制的532nm多普勒激光雷达主要用于测量临近空间的大气风场、温度和密度等参数。该激光雷达采用种子注入技术获得窄线宽的脉冲激光,使用碘
缺血性脑卒中是全球高发病率和高死亡率的主要疾病之一。脑水肿是缺血性脑卒中最大的并发症之一,是大面积缺血性脑卒中患者急性期恶化和死亡的主要原因。星形胶质细胞是脑水
转录因子,是指能够与位于真核基因启动子区域中的顺式作用元件结合并发生特异性作用的蛋白质,通过两者之间及与其它相关蛋白的相互作用来激活或抑制转录起始,或者参与调控基
应力发光(Mechanoluminescence,ML)泛指在机械力作用下受力物体或周围介质发光的现象,常见于于各种固体受力过程,可分为摩擦发光和形变应力发光两大类。近年来,形变应力发光
在全球气候变化的背景下,分析降水和变化环境的特征,探寻和建立降水与环境因子之间的关系,可以为进行降水、变化环境定量化预测研究建立一定的理论基础和有效方法。前人做了