利用ISSR分子标记和rDNA的ITS序列研究五针松亲缘关系

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利用ISSR和ITS分子标记技术,对分布于国内外的13种五针松的亲缘关系进行研究,研究结果表明: 1.利用12个随机引物对12种五针松的亲缘关系进行了ISSR分析,共检测到117个位点,多态位点百分率在9.40%~33.33%之间,多态位点百分率最高的是俄罗斯偃松(P.pumila)33.33%,最低的是柔枝松(P.flexilis)9.40%。 2.利用Shannon指数与Nei指数估算12种五针松的遗传变异,五针松的Nei指数(~*H)的变化范围在0.0346~0.1306之间,Shannon指数(~*I)的变化范围在0.0518~0.1910之间,两个指数均表明:遗传变异最高的是俄罗斯偃松,最低的是柔枝松。 3.根据Nei法计算12种五针松的基因多样性(Ht)为26.21%,其中种内基因多样性(Hs)为7.66%,种间基因多样性(Dst)为18.55%,五针松种间变异占总变异的70.78%,种间遗传变异水平较高。 4.利用ISSR分子标记构建的12种五针松的遗传关系聚类图,在阈值0.358处将12种五针松分为2个类群,第一类群包括乔松、华山松、海南五针松、华南五针松、美国白松、山白松、云南五针松;第二类群包括俄罗斯偃松、大兴安岭偃松、美国白皮松、红松、西伯利亚红松、柔枝松。 5.利用rDNA的ITS序列对13种五针松的亲缘关系进一步进行分析,得到13种五针松ITS序列全长为3kb,其中5.8SrDNA长度为161~163bp,种间相差2bp;ITS-2序列长度为236~245bp。经测序得到的13种五针松ITS-1的部分序列、5.8S和ITS-2全部序列作为一个共同数据距阵进行分析,构建了13个树种的系统发育树。 6.将本研究得到的13种五针松与从NCBI数据库中调取的其它7种五针松ITS序列一起分析,构建了20个树种的五针松系统发育树。
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