基于IonTorrent测序平台的肿瘤用药指导检测及临床应用

被引量 : 0次 | 上传用户:chufs
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
1.目的基因检测目前已经是肿瘤治疗中,特别是靶向药用药前不可以缺少的一部分。现有方法主要是基于Sanger测序技术。随着新一代测序技术的发展,这种快捷、高通量、高灵敏度的测序方法正在逐渐走向临床。本文通过对2例肺癌组织样本和5例肺癌病人血浆样本在Ion Torrent上进行测序分析,证实基于Ion Torrent测序平台的肿瘤用药指导测序是可靠的。找到潜在的导致两例病人服用厄洛替尼效果差异原因,并验证从血浆中检测肿瘤体细胞突变的可行性。2.方法1.提取DNA及测序。从2例肺癌样本(1例厄洛替尼效果好和1例厄洛替尼效果差)和5例肺癌术前血浆样本(对应的组织样本已经有sanger检测的结果)中提取DNA。2.根据Life Technology Cancer Panel标准流程对DNA样本使用多重PCR富集,得到DNA片段经过纯化、建库之后在Ion Torrent上进行测序。3.对测序数据进行分析。4.对2例肺癌组织样本的突变结果进行信号通路综合分析,从而得到潜在的导致两个病人使用厄洛替尼后效果不同的原因。5.将5例血浆样本及其对应组织样本的突变同已知的组织样本的突变比较分析,观察是否在血浆中可以检测到对应的突变。3.结果:1.检测结果的特异性分析:对2例组织样本突变检测结果进行Sanger测序验证,验证率100%。将5例血浆样本突变检测结果和已知Sanger检测结果做比较,检出率100%,最低的一个样本5.4%的突变频率可检出。2.临床意义解读:对2例组织样本突变检测结果涉及的基因进行了综合分析,从信号通路的角度进行解读,在厄洛替尼无效的病人中发现MET上的一个非同义突变可能是其无效的潜在原因。4.结论血浆突变检测实验中,我们在患者术前血浆中检测到的突变与手术切下的组织中一致。说明了在血浆中检测肿瘤体细胞突变的可行性。这一成果对晚期无法手术病人的用药指导有非常大的意义。在使用Ion Torrent Cancer Panel突变检测时,除了常见的EGFR,KRAS,BRAF,KIT等常见靶向性药物相关基因,还可以同时检测MET,ALK,APC,PIK3CA,PTEN等基因突变,可以更全面指导患者用药,找出更适合患者的药物,且可以同时针对多种癌症进行检测。我们通过对两例在传统方法上基因相同,实际用药效果却不同的样本的测序分析,找到潜在导致他们表型不一致的原因。
其他文献
<正> 巴黎公社早已为众人所周知,它既是法国历史的,也是国际工运史的一个转折点。在我国,拉雪兹神甫公墓也因巴黎公社而闻名。本文作者在法国进行科研与应邀执教的两年多时间
期刊
随着近代胶粘剂的出现与发展,在光学仪器的生产和装配中,越来越多的工程师使用各种结构粘合剂代替机械固定方法中的螺钉、压板及其它形式的紧固件。但是,由于连接镜框与镜头的胶
目的本研究通过对一个遗传性肾脏病家族进行家族调查、肾脏病理检查及基因测序,确定该遗传性肾病的遗传特征及发病特点,分析其可能的诊断,并探讨其分子遗传学机制。资料与方法1
2004年以来,中央连续发布了10个关于“三农”问题的一号文件,而最近的“十二五”规划以及《金融业发展和改革“十二五”规划》也提到了要促进农村经济发展,加大对三农的投入,改革
国学启蒙是以中国文化最经典部分来取材,因材施教,对儿童进行国学的浸透与熏染。阐述了国学启蒙教育实施中应遵循的原则,论述了国学启蒙教育的方法及采取的具体实施策略,并提
<正>历史学科能力培养是历史教学的重要目标,而习题训练则是促进学科能力发展的主要途径之一。20世纪90年代末,《历史教学》杂志连续刊登了白月桥先生的《习题的分类标准和类
<正>在高中试行新课程标准以来,历史学科体系与历史学科能力到底应该置于教学和人才培养的什么位置,似乎并没有一个明确清楚、合情合理的说法与定位。一方面,在普通高中历史
蛋白质是生命体的物质基础,在生物体内有着特殊的地位,是一切生物体的重要组成部分。药物与蛋白质的结合作用直接影响着药物在体内的分布、代谢及排泄方式。高血压病是最常见的
近年来,随着我国经济的迅猛崛起,独柱墩曲线桥以其造型美观,线条流畅、占用面积比较小、工程造价比较低等等多种优点得到广泛的应用。但对独柱墩曲线梁桥的独特受力性能缺乏足够
我国由于民间借贷问题引发的大量事件引起全社会的关注和思考。把握民间借贷问题的实质,化解民间借贷问题成为研究的重要课题。完善民间借贷法律制度,加强民间借贷的监管力度