UNC5D的系统生物信息学分析及其在肾癌生物学行为预测中的应用

来源 :中国医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:kennshi
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目的:对UNC5D基因进行基因结构分析,保守性分析,转录调控分析,表观遗传分析,临床相关数据计算及其在肾癌中的共表达基因信号通路富集分析,为研究UNC5D在癌症中检测及治疗提供参考。方法:通过UCSC基因组浏览器、ECR browser、MethPrimer、JASPAR、TCGA、starbase、cBioPortal、DAVID及KEGG等公共数据库和在线工具分析软件对UNC5D序列,转录调控,表观遗传,临床表达进行整体分析,并通过TCGA数据库利用SPSS软件具体分析了肾透明细胞癌患者中UNC5D对临床患者生存及分期分级,通过Cbioportal寻找UNC5D在肾透明细胞癌中的共表达基因,对预测的基因集进行信号通路富集分析,预测UNC5D可能存在的下游信号通路。结果:研究表明,人UNC5D基因定位于8p12,其上下游邻近多个肿瘤抑制相关基因。UNC5D基因序列在哺乳动物中高度保守,其多个转录本可能翻译出不同蛋白。UNC5D基因主要表达于成人神经系统和泌尿生殖系统,且在多种肿瘤中表达呈明显下降趋势,其表达量的下降可能与启动子区的高甲基化水平有关。UNC5D的表达量差异对肾癌患者生存存在显著影响,同时在临床相关参数中存在显著差异。肾癌中UNC5D共表达基因集的信号通路主要富集在代谢及炎症相关通路上。结论:UNC5D可能在多种癌症中尤其是肾癌中作为肿瘤抑制因子行使其生物学功能。
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