家兔感染C株和Shimen株脾脏转录组比较分析

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我国是养猪大国,养猪业在我国农业经济中占有较大比重,猪瘟(CSF)是影响养猪业健康发展的重要因素之一,我国将其作为一类疫病优先防治。上世纪中期以来我国一直采用接种猪瘟兔化弱毒疫苗(C株)和扑杀政策相结合的方法控制猪瘟的流行,但是疫情仍时有发生。关于C株的起源至今没有明确结论,学者普遍认为它是猪瘟病毒石门株(Shimen株)在家兔体内传代后获得的一株弱毒疫苗株,能引起家兔的定型热反应,免疫猪能获得稳定持久的免疫保护力。本研究试图通过高通量测序手段和转录组学分析技术解读C株和Shimen株引起的家兔脾脏转录调控以及调控的差异性,寻找CSFV感染过程中宿主产生应答的关键基因和功能通路,为阐释CSFV感染的发病机制、C株适应家兔的分子机制奠定基础。研究取得的主要结果如下:1.实时监测家兔在感染C株,Shimen株后5个时间点(12h,24h,30h,36h,48h)的体温变化,发现家兔感染C株后30h体温开始上升,在感染后36h体温变化超过1℃,并保持至感染后48h。家兔感染Shimen株后体温没有明显波动。2.利用高通量测序技术对家兔感染C株和Shimen株后5个时间点和对照组、感染C株和Shimen株之间的转录调控展开比较分析。结果表明,两种毒株都通过改变宿主细胞周期,免疫反应,炎症反应等过程实现自身增值。3.C株和Shimen株的入侵激发了家兔RIG-I样受体、Toll样受体、NOD样受体介导的先天性免疫应答过程,这是机体抵御外来微生物的第一道防线,这些信号通路也能够促进宿主产生适应性免疫反应防御病原体。经过传代弱化后的C株产生的适应性免疫反应可能是产生定型热反应的关键所在。4. CSFV衣壳蛋白上可能存在特殊的氨基酸序列,它和宿主某些抗病毒蛋白的水解作用削减了这些抗病毒蛋白在特异性抗病毒反应中的作用,为CSFV粒子在宿主体内的复制和扩散扫清了障碍。5.感染C株后,CD163, LBH, MS4A3, ATG10, S100 (A8, A9, A12), DEFB124基因上调表达;感染Shimen株后,CCL5, CD36, IL18, LTF, BPI基因上调表达;感染C株和Shimen株相比较,CYR61, CD94, DUSP1, IFI35上调表达。
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