国库集中收付制度是一项“横向到边,纵向到底”的改革,是对传统分散收付方式的改革。鉴于国库集中收付制度改革是一项浩大的工程,涉及面深广,工作量大,仅在高等教育系统中,也不可能做到“一步到位”的全面改革,所以,国家采取“分步骤,有计划”的方式,分阶段进行改革。本论文在国库集中收付制度基础理论和高校实行国库集中收付理论的基础上,以实施新预算法为契机,以省部共建类高校——Z大学为例,分析高校实行国库集中收付制度后,给Z大学带来的积极影响和实施过程中产生的问题,根据Z大学实施国库集中收付制度产生的实际问题,分析产生问题的原因,最后提出高校如何在国库集中收付制度下,完善高校财务管理体制的若干建议。国库集中收付制度对于Z大学来说还是一项相对较新的制度,在实施过程中所凸显出来的问题,是文章研究的重点。主要从两个层面来描述国库集中收付制度在Z大学财务管理中产生的问题:一是从Z大学发展的宏观角度,它限制Z大学的财政自主权,减弱了Z大学的资金统筹职能,最终限制Z大学的发展,并创造性的提出政府采购制度对于国库集中收付制度的影响;二是从Z大学财务管理的微观角度,与国库集中收付制度相配套的软、硬件条件尚不完全成熟,在新预算法的实施下,现有预算的编制方法不够科学,还不能完全适应国库集中收付制度的要求。文章最后一部分从宏观和微观两个层面对Z大学在国库集中收付制度下产生的问题提出相对应的建议:一是国家出台关于高校实施国库集中收付制度的法律政策,调整纳入国库集中收付制度的资金范围和比例,以及政府采购制度要同国库集中收付制度同步改革;二是Z大学本身要强化预算管理,加强与国库集中收付制度相适应的软、硬件建设工作,以积极主动的态度适应国库集中收付制度。