长期以来，经济理论和模型的研究都建立在“经济人”假设的基础上，根据此假设，参与经济活动的人只追求自己效用的最大化，不关注效用收益的分配是否公平。近年来，“经济人”假设遭到了极大挑战，很多著名的经济学家和大量的实证研究令人信服地证明了在现实中人是具有公平偏好的，在关注个人利益的同时，常常也会关心他人的利益，并且公平偏好影响人的行为，进而影响许多社会经济活动。企业员工行为对企业效益有直接的影响，能够决定企业的经营状况和长远利益。对企业员工行为的研究，有助于管理者根据企业实际情况制定适当的管理策略，这是确保企业高效运营的必要条件。本文将公平偏好理论应用到企业员工行为中，为管理者决策提供了有效的依据。首先，通过对公平偏好实验及模型应用现状的评析，确立了本文基于收益公平的建模方法，在此基础上分析了基于公平偏好的企业员工行为，阐明了公平偏好对企业员工行为产生的重要影响。其次，在报酬体系收益方式下对具有公平偏好的企业员工行为进行建模，提出了从企业员工角度出发利用博弈知识求解模型和从管理者角度出发利用成本最小化函数求解模型的整体思路，得到了管理者激励企业员工努力工作的方法。最后，在产出分享机制下对具有公平偏好的企业员工行为进行研究，根据产出分享机制的特点，分析了员工产生嫉妒心理和自豪心理的原因，并分别建立模型进行分析，得到了产出分享机制下激励具有公平偏好员工的方法。