现代车载通信系统往往在有限的空间内上装了种类繁多的电子信息设备，致使系统内部电磁兼容问题日益突出，进行合理的系统电磁兼容指标分配在系统电磁兼容预设计中占据的比重越来越大。针对已有指标分配方法中算法过程复杂且模型中某些重要参数无法获取的问题，本文进行基于实例推理的车载通信系统电磁兼容指标分配方法的研究，实现了新系统电磁兼容指标的快速分配。首先，针对已有的电磁兼容指标体系所呈现的复杂网络关系详细对比了现有指标分配方法的优缺点，提出基于实例推理的思想进行系统电磁兼容指标分配；其次，从体系需求工程的全视角出发，对影响系统相似度的电磁兼容性能的各个要素（能力、使命、装备）进行详细分析，进行数据库构建的需求分析并建立了系统实例库；再次，依据实例推理的类比法思想，分别提出了影响系统性能的定性因素、半定性因素、定量因素的相似度计算公式，建立了基于相似度要素的系统电磁兼容指标分配模型。最后，构建了模糊综合评价模型，对通过类比法得到的系统电磁兼容指标分配方案进行综合评价。通过一个想定系统，分析论证了本文方法的合理性和有效性。