【摘 要】
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目的 以网络药理学为基础,探讨淫羊藿苷(Icaritin)治疗动脉粥样硬化的机制。方法 结合研究的需求由Pub Chem和Swiss Target Prediction数据库获取Icaritin的靶点信息,基于Gene Cards、OMIM、Pharm Gkb、Dis Ge NET、Drugbank和TTD数据库获取动脉粥样硬化相关靶点,在对共同靶点进行KEGG与GO富集分析时选择R语言工具,同时
【基金项目】
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湛江市资助科技攻关计划项目(2021A05090);
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目的 以网络药理学为基础,探讨淫羊藿苷(Icaritin)治疗动脉粥样硬化的机制。方法 结合研究的需求由Pub Chem和Swiss Target Prediction数据库获取Icaritin的靶点信息,基于Gene Cards、OMIM、Pharm Gkb、Dis Ge NET、Drugbank和TTD数据库获取动脉粥样硬化相关靶点,在对共同靶点进行KEGG与GO富集分析时选择R语言工具,同时应用蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,在进行关键靶点的分子对接时选择Auto Dock、Auto Dock Vina、Chem Bio3D和Pymol工具。结果 共获得79种Icaritin与动脉粥样硬化相关靶点,PPI网络中核心基因为TP53、TNF、AKT1、RELA和EGFR等;GO功能富集后富集数目较多的有protein kinase C activity、protein serine/threonine kinase activity、protein phosphatase binding和phosphatase binding等;KEGG富集通路分析显示Icaritin治疗动脉粥样硬化主要通路有Sphingolipid signaling pathway、AGE-RAGE signaling pathway in diabetic complications、Chemical carcinogenesis-receptor activation和HIF-1 signaling pathway等;分子对接结果显示核心靶点蛋白与Icaritin的对接分数均小于-5 kcal/mol,提示分子对接的高亲和力。结论 Icaritin或通过利用多靶点、多通路抑制氧化应激和细胞增殖改善动脉血管重塑。
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