探讨人乳头瘤病毒（HPV）感染患者宫颈菌群特征，分析宫颈菌群与HPV感染及宫颈炎的相互关系。
方法病例对照研究，收集2019年6月至2020年4月在南方医科大学珠江医院行HPV核酸检测300例样本，其中150例HPV阳性为HPV感染组（HPV+），150例HPV阴性为非感染组（HPV-）。采用二代测序技术进行细菌16S rRNA基因V4区测序，用QIIME分析比较组间的菌群构成、多样性和细菌丰度的差异。统计方法采用Wilcoxon秩和检验和Kruskal-Wallis检验对两组和多组间菌群差异进行比较；组间菌群α多样性和β多样性采用Adonis多元方差分析和Wilcoxon秩和检验进行统计分析。
结果本研究共分析300例样本，其中150例HPV阳性和150例HPV阴性；HPV阳性病例中，高危型感染132例（88.0%），低危型18例（12.0%）。HPV+组和HPV-组菌群存在显著差异，且HPV+组样本菌群α多样性显著升高（香农指数， W=8 174， P<0.000 1；PD whole tree， W=8 887， P=0.001 7）；两组间菌群β多样性差异显著（Binary Jaccard，F=2.325 4， P=0.042 0；Bray Curtis，F=2.136 44， P=0.044 0）；HPV+组样本乳杆菌属（Lactobacillus spp.）以及惰性乳杆菌（L.iners）相对丰度显著下降（W=7 730，P<0.000 1；W=8 979，P=0.002 5），同时伴随着无色杆菌属（Achromobacter）、窄食单胞菌属（Stenotrophomonas）、甲基杆菌属（Methylobacterium）、纤毛菌属（Sneathia）和类小杆菌属（Dialister）等细菌富集。高危型HPV感染和低危型HPV感染的样本菌群构成差异无统计学意义（F=4.100 4，P>0.05）。此外，宫颈炎与HPV感染显著相关（χ²=19.78，P<0.000 1）。宫颈菌群结构在HPV感染以及宫颈炎合并HPV感染间存在一致性趋势；与正常组相比，宫颈炎合并HPV感染样本菌群主要富集无色杆菌属（Achromobacter）、气球菌属（Aerococcaceae）、链球菌属（Streptococcus）、窄食单胞菌属（Stenotrophomonas）、梭杆菌科（Fusobacteria）、黄单胞菌科（Xanthomonadaceae）等细菌。
结论HPV感染患者存在显著的宫颈菌群紊乱特征，主要表现为菌群多样性升高及显著的乳杆菌缺失，并伴随无色杆菌属（Achromobacter）等多种条件致病菌丰度升高。