Haploview与PHASE在单体型研究中的应用

来源 :福建医科大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：xinxin3690

【摘要】

：

目的探索Haploview与PHASE软件在单核苷酸多态性单体型分析中的应用。方法利用Hap-Map 2009年Ⅲ期发布的XRCC2基因单个单核苷酸多态性（SNP）数据,通过Haploview4.2选择标签SNP,P

【作者】

：

黄萌蔡琳

【机构】

：

福建医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系

【出处】

：

福建医科大学学报

【发表日期】

：

2009年4期

【关键词】

：

等位基因多态性单核苷酸基因型

【基金项目】

：

国家自然科学基金(30771845);福建省科技开发计划资助项目(2005D075);福建省教育厅科技项目(01601065)

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目的探索Haploview与PHASE软件在单核苷酸多态性单体型分析中的应用。方法利用Hap-Map 2009年Ⅲ期发布的XRCC2基因单个单核苷酸多态性（SNP）数据,通过Haploview4.2选择标签SNP,PHASE2.1构建单体型,并比较北京汉族人（CHB）与东京日本人（JPT）中相应单体型的差异。结果在CHB和JPT数据对应人群中,以XRCC2 rs3218552、rs3218534r、s3218458r、s3094406和rs3218408五个标签SNP构建的单体型分布差别有统计学意义。结论

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