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1949年成立的中国科学院是一个综合性学术研究机构，兼顾自然科学和哲学社会科学研究。1955年召开学部成立大会后，因为和意识形态关系紧密，哲学社会科学学部所走的道路较为特殊，和中国科学院的隶属关系呈现了阶段性特征。身为院长的郭沫若同时也是哲学社会科学学部主任，从筹划到组建学部，他是事实上的掌门人。学部党组力量加强后，郭沫若逐步将领导权转交。当学部划归中宣部领导后，郭沫若的学部主任职务仅是挂名，除了形式上参加学部的重大活动，事实上已经脱离了对学部的领导。