RNA中m~6A甲基化修饰与家蚕滞育的关联研究

来源 :江苏科技大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:aiyang1115
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
RNA腺嘌呤第6位氮原子甲基化(m~6A)是核酸表观遗传修饰研究的热点。RNA中发生m~6A修饰后,可调节包括RNA剪接、核转运、RNA降解、翻译一系列下游事件,在生物体的生长、发育、疾病和应激反应等方面发挥了重要的作用。家蚕是重要的经济昆虫和鳞翅目模式生物,遗传背景清楚,是研究表观遗传学的良好素材。二化性家蚕子代滞育的发生与解除都受到外界信号的调控,极可能与表观遗传调控相关。本研究从RNA m~6A表观遗传修饰角度出发,研究m~6A表观修饰与家蚕滞育的关联。主要研究内容如下:在生物信息学分析家蚕m~6A甲基化工具酶基因的相关信息的基础上,q PCR和Western blot技术分析了m~6A甲基化工具酶在一化性、二化性、多化性家蚕中的转录特性和表达水平,检测了多化性不同滞育性家蚕品系相关组织中m~6A丰度的变化,分析了外界因素与m~6A甲基化修饰的关联,对二化性家蚕胚胎期不同处理组蛹期第3d卵巢进行表观转录组测序(Me RIP-seq),分析了m~6A修饰与家蚕滞育的关联。主要研究结果如下:1、家蚕中存在5种m~6A甲基化工具酶同源基因从NCBI数据库查找了部分物种的m~6A甲基化工具酶序列,采取同源比对的方式从家蚕基因组数据库中找到5个m~6A甲基化工具酶同源基因,分别为METTL3、METTL14、Fl(2)d、YTHDC1、YTHDF3。系统发育学的分析结果表明,这5个基因在不同物种中具有较高保守性。2、不同滞育性家蚕中m~6A甲基化工具酶的转录水平具有差异性采用q RT-PCR的方法分析了一化性品系安康4号(AK4)、二化性品系秋丰25℃明催青(QFHT)和17℃暗催青(QFLT)、多化性品系の海(NH)与Nistari 5个实验组家蚕从蛹期至蚕卵不同发育时期的卵巢、头部、蚕卵,m~6A甲基化工具酶的转录特性。结果显示,不同滞育性家蚕中m~6A甲基化工具酶基因的转录存在差异,特别是同一化性但滞育性不同的家蚕,基因转录的模式具有显著区别,提示家蚕的化性及滞育命运与m~6A修饰存在关联。3、不同滞育性家蚕中甲基转移酶METTL3蛋白表达具有特异性采用western-blot的方法,分析了一化性、二化性、多化性等不同滞育性家蚕蛹期不同发育时期卵巢中METTL3的蛋白表达情况。实验结果进一步确认了家蚕中METTL3的存在,而且不同滞育性家蚕中METTL3的蛋白质表达具有差异性,这种蛋白水平的变化与转录特性分析的结果具有较高一致性。4、多化性滞育与非滞育性家蚕卵巢m~6A丰度存在差异对多化性不同滞育性家蚕蛹期卵巢与蚕卵中m~6A丰度的变化用荧光免疫的方法进行了检测。结果显示,多化性有滞育和多化性无滞育家蚕在蛹期与蚕卵的不同发育时期,m~6A丰度有显著变化,多化性非滞育家蚕卵巢和蚕卵中m~6A丰度普遍高于多化性滞育家蚕,这种丰度的变化与METTL3的表达变化具有较好的一致性。5、外界因素影响家蚕m~6A修饰体系的变化采用常规即时浸酸方式处理产下后25℃18h的二化性家蚕蚕卵,使用不同浓度滞育激素处理家蚕Bm N细胞,分别从个体与细胞水平分析了家蚕滞育关联性环境因素对家蚕m~6A修饰体系的影响。结果表明,环境因素显著改变了家蚕m~6A甲基化工具酶的表达及m~6A丰度。6、RNAi和Trim-Away可显著敲降METTL3分别使用RNAi与Trim-away的方法,结合显微注射技术,对蚕卵注射ds RNA,或注射外源抗体与泛素蛋白酶系统,靶向沉默METTL3的表达。结果表明,RNAi可在转录水平显著抑制METTL3的表达,Trim-away可在蛋白水平快速消减METTL3的存在。7、不同滞育性的二化性家蚕蛹期3天卵巢表观转录组存在显著差异对二化性QFHT组和QFLT组家蚕蛹期3d卵巢进行Me RIP-seq。结果表明,两组家蚕的表观转录组存在显著差异,相比QFLT,子代滞育命运的QFHT中发生了更多m~6A事件,这种差异不仅体现在修饰基因的数量、种类与功能,而且体现在基因位点修饰频率上,进一步表明m~6A修饰深度参与了家蚕滞育这一可塑性表型的塑造。上述结果证实,家蚕的滞育性与m~6A表观修饰密切相关,环境因素的滞育信号可能通过对m~6A修饰系统的作用进一步影响滞育关联基因的表达,引起家蚕滞育性的改变。研究结果为从m~6A表观遗传层面进一步阐释家蚕滞育机制奠定了基础。
其他文献
本研究以冀张薯12号(J12)与尤佳70(Y70)品种为材料,通过盆栽试验,在自然条件下系统地研究了块茎形成和发育过程中植株形态、干物质积累、碳氮代谢,矿质元素含量、内源激素含
在交通场景理解中,基于视觉的目标检测与场景分割发挥着重要的作用。本课题主要来源于国家自然科学基金重大项目“自主驾驶车辆关键技术与集成验证平台”与国家自然科学基金
慢性硬膜下血肿(CSDH)是神经外科常见疾病。目前,锥颅或钻颅血肿清除等手术治疗仍然是CSDH患者的一线治疗方法;然而这些手术方法具有较高的血肿复发率以及手术相关并发症发生
沉水植物茎叶微界面因其特殊的结构组成在富营养化水体中具有重要的生态作用。以典型沉水植物茎叶微界面为研究对象,综合利用扫描电镜技术、高分辨率微电极测定技术、微量化
同普通电火花钻孔技术相比,超声辅助电火花加工技术可以减少微裂纹尺寸和重铸层的厚度,且具有更高的材料去除率。由于小尺寸工件容易实现超声振动,目前针对超声辅助电火花钻
尾矿作为我国大宗工业固废来源之一,在当前经济技术条件下利用率仍较低。探索尾矿开发利用的新途径,成为我国生态文明建设与社会可持续发展的必然要求。本论文以硅质尾矿资源
量子信息科学是由量子力学、信息科学和计算机科学等多个学科交叉而形成的一门新兴学科。与经典信息处理相比,量子信息处理在运算速度、信息容量、检测精度以及信息安全等方
胶原酶是特异性作用于胶原蛋白、明胶的一类蛋白水解酶,它能够水解胶原蛋白的三维螺旋结构而不破坏其他蛋白与组织。微生物胶原酶来源主要是梭菌属、芽孢杆菌属和弧菌属菌株
随着高分子合成工业与加工制造业取得的进展以及高分子材料制品在国民经济和国防工业等领域中日益广泛的应用,高分子材料制品的精密化、高性能化与科学发展的环保需求已成为
激光脉冲到达时刻的精确测定是实现高精度激光时间传递的关键技术,这对单光子探测器的精度与稳定度要求极高。当前最先进的时间传递系统,对整个链路的精度要求已经达到~20 ps