泡桐黄化突变体是从白花泡桐杂种育苗中筛选而来,其叶色突变的研究以前未见有活体标本,因此未见研究报道,本研究采用的植物材料经过多年繁殖培育,叶片及茎秆均为黄色,与其它正常泡桐相比差异显著,且其特异性状表现稳定,但对其形成机理及生长发育过程中的生理特性和分子机制并不清楚。因此本研究以泡桐黄化突变体和其它品种泡桐为材料,研究了生理特性和转录组信息。(1)以泡桐黄化突变体(PFE)与白花泡桐(PF)、建始泡桐(PJ)和楸叶泡桐(PC)为研究对象分析了它们的光合色素的含量、光合日变化、抗氧化酶活性及丙二醛含量。结果发现,黄化突变体的叶绿素a、叶绿素b、总叶绿素、类胡萝卜素含量减少,其中叶绿素b显著减少;黄化突变体的净光合速率和蒸腾速率总体小于其它品种,气孔导度值差异较小,总体降低,胞间CO2浓度日变化值均高于其它品种;泡桐黄化突变体的SOD,POD,CAT活性和丙二醛(MDA)质量摩尔浓度均高于其它品种。(2)利用Illumina测序平台对白花泡桐(PF1,PF2)和泡桐黄化突变体(PFE1,PFE2)进行转录组测序,得到18.15Gb数据,组装去冗后得到81610个Unigene,总长度,平均长度,N50分别为101727851 bp,1246 bp和2014 bp。将Unigene与七大数据库比对发现有共62575条(76.68%)Unigene可以比对到至少一个数据库,与Nr数据库比对到最多的物种是芝麻,5702条Unigene注释到GO数据库52个功能类别,24062条Unigene注释到COG数据库25个蛋白质家族,42185条Unigene注释到KEGG数据库21个通路,预测了56710个CDS。Unigene可以编码58个转录因子家族,编码最多的转录因子家族为MYB、MYB-related、C3H,b HLH和AP2-EREBP,检测到5011个SSR位点,重复类型主要是一至三核苷酸,四至六核苷酸较少,共检测到207273个SNP,白花泡桐SNP数量高于泡桐黄化突变体,转换的数量高于颠换。根据基因水平表达结果共检测到白花泡桐和泡桐黄花突变体有1664个显著差异基因,817条上调,847条下调基因,672个差异基因注释到GO数据库34个功能中,Unigene参与最多的是催化活性(catalytic activity)、结合(binding)、代谢过程(metabolic process)和细胞内生物过程(cellular process),1146个差异基因注释到KEGG数据库发现参与的代谢过程或通路共122个,与叶绿素代谢相关的途径有5个,找到与LCHA2,psa L、Psb R、CHLP、AAO3等同源的21个叶绿素代谢途径相关的差异基因,对叶绿素合成或降解产生影响,类胡萝卜素合成途径相关差异基因均为上调。