小黑杨与Alternaria alternata互作后基因表达模式分析

来源 :东北林业大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:tony_guang
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杨树叶枯病是由链格孢菌引起的叶部病害,本研究以杨树及叶枯病病原菌为研究对象,鉴定了叶枯病病原菌及其分子特性,分析了病原菌应答H202胁迫的转录水平变化,也分析了杨树应答叶枯病菌胁迫转录水平变化,希望今后鉴定抗病基因和改良杨树抗病性奠定基础,具体结果如下:首先,对叶枯病病原菌进行分离纯化,得到纯菌种,进而确定适合菌落生长的条件和温度。根据植物细胞受到胁迫产生大量活性氧的原理,用H2O2溶液模拟活性氧条件处理病原菌,将实验组和对照组样品进行转录组测序。结果表明,在活性氧胁迫条件下,病原菌基因表达量发生明显变化,将差异表达基因与GO、COG、KOG和KEGG数据库比对,发现差异表达基因功能涉及多种过程,在代谢、运输、膜结构等方面富集到的基因数量较多。用叶枯病病原菌对杨树叶片进行胁迫处理48小时,利用RNA-seq技术检测基因差异表达情况,结果是表明杨树叶片在胁迫下基因表达发生明显变化,主要涉及代谢过程、氧化还原酶、膜结构、发病机制相关蛋白等方面,参与到光合作用等14条代谢通路中。共发现27个转录因子,涉及到WRKY、MYB、bZIP等家族。分别在胁迫0、4、8、12、24、48和72小时进行镜检观察,利用RNA-seq检测基因表达情况。将非胁迫T0组为对照,分析基因差异表达情况,WRKY基因在不同时间点的表达模式。结果显示6.个胁迫时间点分别有436、448、411、374、459和241个基因发生了差异表达,184个WRKY基因时空表达模式也发生了变化。利用RT-qPCR技术检测18个WRKY基因的时空和三个组织的表达模式,表现为杨树应答叶枯病菌胁迫出现“诱导-恢复”的趋势,且发现叶部最显著,其次是茎部,而根部不响应胁迫,具有组织特异性。
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