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LTR类反转座子在植物基因组的丰度、进化、结构和功能上起到了重要的作用。柽柳(Tamarix chinensis Lour.)作为一种优秀的耐盐碱耐旱的生态修复植物,其LTR类反转座子的研究未见报道。本实验以柽柳为实验材料,利用CTAB法提取DNA,利用简并引物对LTR类反转座子反转录酶序列进行扩增并进行扩增子测序。分别得到93602条Ty1-copia反转座子的RT序列,121185条Ty3-gypsy反转座子的RT序列。经筛选后序列进行相似度93%的聚类分析,最终获得具有反转座子代表性的Ty1-copia反转座子RT核苷酸序列629个,命名为TCcopia1~TCcopia629;Ty3-gypsy反转座子RT核苷酸序列607个,命名为TCgypsy1~TCgypsy607。Ty1-copia反转座子RT核苷酸序列的长度为261bp~291bp,Ty3-gypsy反转座子RT核苷酸序列的长度为390bp~474bp,二者皆富含AT序列,Ty1-copia反转座子RT核苷酸序列的AT/GC值在1.09~2.43之间,Ty3-gypsy反转座子RT核苷酸序列的AT/GC值在0.98~2.48之间。ClustalW序列同源性比对的结果显示,柽柳Ty1-copia反转座子RT序列间的核酸相似度为21.01%~92.83%,柽柳Ty3-gypsy反转座子RT序列的核酸相似度为17.98%~92.80%;其中有Ty1-copia反转座子中有420条序列含有终止子插入,Ty3-gypsy反转座子中有486条序列含有终止子插入,这可能是柽柳LTR类反转座子高度异质性产生的原因。无终止子的Ty1-copia反转座子RT氨基酸序列含有“QMDVKT”、“YVDDM”、“FLNGDL”以及“SLYGLKQA”四个保守域;无终止子的Ty3-gypsy反转座子RT氨基酸序列含有“MCVDY”,“LYAKLXKC”,“KTAFRT”,“DLRSGYHQ”以及“VMPFGLTNAP”五个保守域。柽柳的Ty1-copia反转座子主要分布在四个家族,分别为Angela,Ale,Ivana和TAR家族,其中TAR家族所含有的转座子数量最多;Ty3-gypsy反转座子主要分布在三个家族,分别为Del、Reina、和CRM家族,其中Del家族和Reina家族为Ty3-gypsy反转座子的主要组成。柽柳的反转座子与红树、野生马铃薯、阳芋的进化距离较近,可能发生了水平转移。本实验为进一步研究柽柳反转座子转录活性和功能奠定基础,也为开发柽柳反转座子分子标记提供帮助,同时为柽柳与其它物种的进化关系和遗传变异研究提供新信息。