乙烯诱导的矮牵牛花瓣转录组、蛋白组与泛素化组分析

来源 :华南农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:Dream_624727
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
矮牵牛的衰老是一个复杂的程序化过程。已有的研究表明乙烯是一种参与植物衰老的激素,用乙烯处理植物能极大的改变其转录组和蛋白组的表达水平。然而我们对乙烯在转录后修饰所起的作用以及翻译后修饰(PTM,post-translational modification)与蛋白组之间的联系却知之甚少。衰老的标志性事件之一是蛋白质降解,而泛素化作为真核生物翻译后修饰的主要方式之一,在蛋白质降解方面起重要作用。然而还没有人在花衰老对乙烯的响应的翻译后修饰方面做过分析,从而去揭示蛋白组的泛素化或者蛋白组与修饰之间的关联性。在本研究中,首先通过转录组测序获得矮牵牛相关的转录组数据库,并对经过乙烯处理的矮牵牛花瓣的蛋白组、泛素化组进行了定量分析以及它们之间进行了关联分析,得到的主要结果如下:1.在经过乙烯处理16 h矮牵牛花瓣的转录组、蛋白组以及泛素化组中总共得到51 99个Unigene,3606个蛋白以及22 0个泛素化位点。2.乙烯处理后,在转录组中有14448个Unigene表达下调和6303个Unigene表达上调;在蛋白组中有284个蛋白表达下调和233个蛋白表达上调;在泛素化组中有320个泛素化位点上调和12个泛素化位点下调。说明在矮牵牛乙烯参与的花瓣衰老过程中泛素化的整体水平是增加的。3.在整体水平上蛋白组和泛素化组呈负相关,一些推测的泛素化连接酶在蛋白水平和转录水平表达是上调的。说明在矮牵牛中乙烯参与的花瓣衰老过程泛素化可能参与到蛋白质的降解;而且一些非蛋白酶体蛋白酶和自噬蛋白也参与到蛋白质的降解。4.对泛素化蛋白的序列特性进行分析,在3,265个Kub的多肽中,从1,3 3个独特的位点总共鉴定出5种保守序列,其中有四种保守序列还没有被报道过。在蛋白质的二级结构上对Kub位点进行预测,泛素化赖氨酸位点显著的高频率处在蛋白的非结构区域。对植物中泛素化赖氨酸和非泛素化赖氨酸的进化保守性进行研究,结果却显示泛素化赖氨酸反而没有非泛素化赖氨酸更有保守性。5.在矮牵牛花瓣中乙烯在蛋白质和泛素化水平上调控激素的信号转导、蔗糖生物合成和转运,在蛋白质水平上调控挥发性有机化合物的生物合成和氨基酸合成。此外,乙烯处理使得一些参与到内质网相关降解途径蛋白的泛素化水平有所增加。并在许多蛋白质中发现了许多新的泛素化位点,包括PhETR2、PhACO、PhCb5s和PhAUX1等。
其他文献
作为国内外物流的关键支撑力量,港口的发展受到众多关注。随着全球范围内竞争的日益加剧以及信息技术的发展,现在的港口逐步向智慧化,精细化发展。目前,国家和港口两个方面都十分重视港口的智慧化转型。根据运输货物的方式,港口可以分为散杂货港口和集装箱港口。与集装箱港口相比,散杂货港口货物类型和形状不定,整体作业流程较为粗放,智慧化程度低,亟待转型。港口的智慧化是一个内涵丰富的概念,涉及到了港口的方方面面。本
在人类文明的过程中,病毒感染和癌症已经造成数全球数百万人员的伤亡。在2019年末新型冠状病毒肺炎(COVID-19)所引发的肺炎席卷了全中国乃至全球。由此而引发了对抗病毒药物
随着国民经济的不断发展,汽车机械工业在我国的经济发展中逐渐占据重要地位,轮胎行业随之也在迅速的发展。轮胎的安全性能、外观及寿命等重要工作性能很大部分依靠其表面花纹
类胡萝卜素是一种广泛存在于自然界中的天然色素,在植物的叶、花、果实和根器官中存在较多,使植物兼具观赏价值和经济价值。类胡萝卜素对人类和动物的营养和健康起着重要作用
本文主要探讨了两类高阶非线性系统的快速有限时间控制问题.一,带有零动态和输出约束的高阶非线性系统的快速有限时间镇定问题.针对带有零动态和输出约束的高阶非线性系统,本
随着人口的快速增长和经济的飞速发展,环境问题日益凸显,水污染问题成为威胁生命健康的首要问题。迫切需要寻求一种绿色环保且操作简单的方法来处理水污染问题。纳米结构吸附
三唑类杀菌剂是目前应用范围最广、使用量最大的一类杀菌剂,已广泛用于病原真菌的防治。三唑类手性杀菌剂一般具有一对或多对对映体,其对映体具有不同的生物活性、毒性和环境
银行保险在国内的发展20多年了,随着国人对投资理财和保险保障日益增加的需求,银行与保险公司的合作也越来越深入。无论是保险公司还是银行都越来越重视银行保险的合作与销售
玉米赤霉烯酮(Zearalenone,ZEA)是由禾谷、黄色和木贼等镰刀菌属类真菌产生的一种具有雌激素样活性的真菌毒素。胸腺是动物机体重要的中枢免疫器官,胸腺上皮细胞对免疫功能发挥
绵阳市处于龙门山前缘向四川盆地过渡带。属于四川盆地盆中丘陵区的北部,一般山顶标高均在500m以上。地貌属构造剥蚀形成的中低山地貌,主要受控于复杂的地质构造、构造运动及外营力地质作用,地形高差变化大,山坡呈阶梯状缓坡平台地形。该地区的基岩多为粉砂质泥岩,由于粉砂质泥岩所含的可溶性物质较多,透水性较差、含水较多,因而比较软,为软岩。近年来国家对绵阳山区道路的建设过程中涉及到较多关于边坡支护的问题。桩板