本文介绍了我们建立的一套共聚焦显微图像计算机辅助分析系统(CMIAS-Confocal Microscopic Image Compute-aided Analysis System)。该系统包括了激光扫描共聚焦显微镜和计算机辅助分析系统，实现了从共聚焦显微图像的获得、预处理、三维可视化到数据分析等一系列功能。 系统针对共聚焦显微图像的特点，建立了一系列适合生物医学研究的图像的三维可视化方法包括体绘制、面绘制算法，作为CMIAS系统的重要组成部分。本文着重介绍了面绘制算法，并将它重点应用到钙离子表达的神经细胞的形态结构研究上。 目前CMIAS系统已成功地应用于“神经细胞胞内钙离子空间分布的研究”和“神经细胞胞内一氧化氮释放的空间分布研究”，为生物医学研究提供方便可靠的工具。