五味子(Schisandra chinensis(Turcz.)Baill.)为木兰科多年生的木质藤本植物,最早收录于《神农本草经》中,以其干燥成熟果实入药,具有收敛固涩,补气生津,静心凝神的功效。五味子作为食物添加剂和酿酒原材料等具有广泛的应用价值,现已进入人工栽培的阶段;大量研究主要集中在五味子的药理作用、化学成分、栽培技术、资源、种质培育等方面,对五味子遗传背景信息知之甚少,因此从分子层面上揭示五味子果实发育的动态特征具有重要意义,也为今后五味子优质的品种选育奠定了理论基础。为此,以五味子坐果期(S1)、幼果期(S2)、生长期(S3)、成熟期(S4),四个不同发育时期的果实作为试验材料,进行转录组的测序,建立转录组数据库,对最终得到的转录组数据进行生物信息学分析,得到的结论如下:1.对五味子四个不同时期果实获得的转录组数据进行过滤,纠错,去冗余后一共得到122,289条转录本序列,最长的转录本长度为12,722bp,最短的转录本长度为109bp,所有转录本的平均长度为2,592bp,N50长度为4,232bp,GC含量为49%,相关性系数为0.98,表明测序结果具有较高准确性,得到的全长转录本序列可以用于后续分析以及作为二代数据的参考转录本序列。2.在果实四个不同发育时期共得到7,225条差异表达的基因,其中上调基因一共有3,593条,下调基因一共有3,632条。将得到的转录组数据与NR,GO,KOG,KEGG,Swiss-Prot五个数据库进行比对,共有97,923(80.08%)、53,054(43.38%)、33,205(27.15%)、37,133(30.36%)、68,793(56.25%)条转录本序列注释到这五个库中,其中,有24,280条转录本序列未注释到任何一个数据库中。3.对获得的差异表达的基因进行功能注释及富集分析,结果表明,差异表达基因主要富集在4条通路中,为结合作用、催化活性、代谢过程和细胞过程;显著富集通路结果表明差异表达基因涉及最多的为苯丙酸的生物合成途径。4.经过比对和搜索,筛选出木脂素生物合成途径中差异表达的26个关键酶基因序列,涉及到9种关键酶,选择其中的12个差异表达基因序列进行qRT-PCR验证,相对表达量的结果与转录组测序的FPKM值的变化趋势保持一致。