战略性新兴产业是近年来我国为了应对国际金融危机，为了缓解国内经济发展面临的产业结构优化升级和经济增长方式转变的双重压力提出来的。本文基于自组织理论，以复杂性科学的思想对战略性新兴产业系统的演化发展过程和机制展开研究，对当下我国更好的培育和发展战略性新兴产业具有重要的理论意义和现实价值。　　战略性新兴产业系统是经济巨系统中的一个子系统；其自身又是由新一代信息技术产业、新能源产业、新能源汽车产业、新材料产业、生物产业、节能环保产业、高端装备制造产业等七大产业子系统构成；七大产业子系统又由科技创新、生产制造、市场需求、政府政策影响等子子系统组成；四大子子系统又由资源禀赋、技术、资金、科技人才、产业价值链等若干要素构成。研究战略性新兴产业系统演化发展依靠单一的理论是不科学的。本文借鉴的自组织理论是一个由耗散结构理论、协同学、超循环论、突变论、混沌理论和分形论组成的理论群，每个理论具有对应的方法论，共同构成自组织方法论。以自组织理论为基础，应用自组织方法论，以复杂性科学的思想对战略性新兴产业系统演化发展的自组织出现的条件环境问题、自组织动力学问题、自组织实现途径问题、自组织结合形式问题以及自组织的复杂性和图景问题展开研究。具体的研究内容如下：　　（1）界定战略性新兴产业的内涵和特征，分析了战略性新兴产业系统的构成要素、特性；研究战略性新兴产业系统的自组织和他组织复合特性；基于耗散结构理论，对战略性新兴产业系统进行了耗散条件的判据和熵分析，应用布鲁塞尔器构造系统的演化模型。　　（2）运用协同学理论分析战略性新兴产业系统的控制参量与熵减机制、状态变量与竞争机制、协同机制；基于哈肯模型构造序参量方程；通过实例探究系统演化发展过程中的序参量及系统动力协同机制；对战略性新兴产业系统演化发展的动力问题深入研究。　　（3）研究战略性新兴产业系统的超循环模式、演化发展的实现途径。分析战略性新兴产业系统演化过程的渐变与突变的统一，借鉴势函数分析系统渐变到突变演化状态，分析战略性新兴产业系统演化突变状态具有尖点突变模型特征。　　（4）研究战略性新兴产业系统演化过程的混沌遍历性、随机敏感性；基于Logistic方程分析系统的演化发展趋势。借鉴灰色关联度的基本原理和熵值赋权法，通过实证分析构成系统的众多要素、子系统的协同性。　　最后，探索到战略性新兴产业系统自组织演化发展过程中存在诸多问题，并针对存在的问题提出相关政策建议。