口腔鳞状细胞癌(OSCC)占口腔癌的90%以上,是全球最常见的口腔肿瘤。基因在口腔鳞状细胞癌的发病机制中起着不可忽视的作用。然而,目前对口腔鳞状细胞癌分子机理的研究还不完全。为了确定与疾病相关的基因,研究人员通常会关注表达值的均值在疾病和正常之间存在差异的基因,实际上在两种不同的生物状态(疾病vs.正常)之间基因表达值的方差如果存在差异同样也具有生物学意义。方差是统计中的另一个重要衡量标准,表示数据集包含的信息量。一般方差越大,数据集包含的信息就越多。本文提出了一种新的口腔鳞状细胞癌相关基因检测方法,在该方法中,不仅比较了口腔鳞状细胞癌患者与对照组基因表达值的均值差异,而且比较了患者与对照组之间的基因表达值的方差差异。目前,比较疾病患者与对照组基因表达值的均值差异,即基因表达差异(DE)分析方法已经成功应用于复杂人类疾病的相关基因检测,如黑色素瘤、浆液性卵巢癌、肺腺癌和头颈部鳞状细胞癌。然而跟据已有文献可知,目前还没有研究来检测口腔鳞状细胞癌差异变异性(DV)基因探针。在具体分析中,基于来自GEO公共数据库的两个基因芯片数据集GSE30784和GSE6791,检测到了456个DV探针,另外还识别出了2 375个表达差异(DE)基因探针。为了区分DE基因探针和DV基因探针对口腔鳞状细胞癌的不同作用,对这2 375个DE基因探针和456个DV基因探针进行了综合分析,结果得到了2 193个仅表达值均值存在差异(DE-only)的基因探针、274个仅表达值方差存在差异(DV-only)的基因探针和182个表达值均值和方差都存在差异(DE-and-DV)的基因探针。DAVID功能分析表明:与DE-only、DV-only、DE-and-DV基因探针相对应的基因在不同的KEGG通路中富集,表明它们在口腔鳞状细胞癌中发挥不同的作用。这种新方法可用于研究其他复杂人类疾病的遗传风险因素。