高校教育投入是支撑国家长远发展的基础性和战略性投资,随着国家财政体制改革的深入,财政专项资金对教育的投入比例逐年加大,在高校办学条件、科研项目、人才队伍建设以及办学特色等方面都给予了很大的资金支持,财政专项资金成为高校预算经费的重要组成部分。但是,高校对专项经费的管理仍然存在诸多问题,其主要原因之一在于专项资金的绩效评价体系不够完善,存在很大的改进空间。因此,完善高校中央专项资金绩效评价体系将有助于帮助高校优化资金配置,提高资金效益,具有实际意义。文章以提高我国高校专项资金的使用效益为出发点,根据财政部下发的关于各类专项资金管理办法的文件精神,在湖南大学现有绩效评价体系的基础上进行改进。文章采取定性和定量相结合的方法,从项目决策、项目管理和项目绩效三个维度细化绩效指标体系,采用层次分析法确定指标权重,并借助功效系数法细化评分方法及评价标准。在此基础上,强化绩效评价结果应用,完善体系的配套管理机制,形成较为全面的高校专项资金绩效评价体系。文章希望在改进湖南大学专项资金绩效评价体系的过程中能够引申触类,为高等院校完善专项资金绩效评价体系提供参考,提高各项专项资金的使用效率,使有限的公共财政资源在高等教育的人才培养、科学研究、社会服务和文化传承等方面发挥其独特而又重要的贡献,帮助我国高等教育事业真正实现可持续发展。