缢蛏糖原代谢关键基因多态性与糖原含量、生长性状的相关性分析

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缢蛏(Sinonovacula constricta)是我国养殖规模较大的海产经济贝类之一,具有重要的营养价值。近年来,缢蛏养殖产业以追求高产量为目标而发展迅速,但对营养品质方面的考虑较少,导致无法满足市场需求。糖原、蛋白质、脂肪是缢蛏重要的营养物质,而糖原影响其生长发育以及风味口感。研究缢蛏糖原代谢相关基因对开展品质改良遗传育种、推动缢蛏养殖业持续健康发展具有重要意义。本研究通过测量浙江缢蛏糖原含量的周年变化,利用RACE技术克隆缢蛏糖原合酶基因(Glycogen synthase,Sc-GYS)和糖原磷酸化酶基因(Glycogen phosphorylase,Sc-GPH)的c DNA全长,分析其在不同组织、不同月份的表达差异,并进一步以筛选出与糖原含量和生长性状相关的SNP位点。研究结果可为培育缢蛏高糖原新品种提供参考依据。主要研究结果如下:1.缢蛏不同组织的糖原含量变化显示,缢蛏在足和外套膜的糖原含量显著高于其他组织(P<0.05);缢蛏的软体部和足、外套膜的糖原含量的变化发现,2月-6月糖原含量较高,4月达到最大值,在6月份后糖原含量逐渐下降,10月份达到最低值。克隆获得Sc-GYS基因的c DNA全长为2 402bp,ORF为2 136bp,编码711个氨基酸。q PCR检测分析,Sc-GYS基因在外套膜和足组织的m RNA表达水平明显高于其他组织,其外套膜和足组织在4月份表达量显著高于其他月份(P<0.01),而且与糖原含量周年变化规律一致,说明Sc-GYS基因似乎受繁殖周期影响。在Sc-GYS基因的编码区筛选到2个SNP位点与糖原含量有关。2.Sc-GPH基因的c DNA总长3963bp,编码区2 541bp,编码区翻译846个氨基酸。实时荧光定量PCR的结果显示,Sc-GPH基因各个组织中均有表达,其中在外套膜和足组织中表达含量最高,与其存储和使用糖原的能力有关;在不同的月份,Sc-GPH在外套膜和足的表达水平从2月逐渐增加,8月份达到最大值,此时糖原含量降低,说明Sc-GPH的表达受缢蛏生殖周期的驱动。在YL1品系Sc-GPH基因编码区筛选到4个与糖原含量相关的SNP位点,其中c.930T>C在TZ群体中得到验证,该位点为可为缢蛏糖原含量的遗传改良提供候选标记。3.缢蛏YL1和TZ群体的糖原含量和生长性状(壳高、壳长、壳宽、总体重、软体部重)关联性结果显示,缢蛏2个群体的糖原含量与壳长、软体重显著相关(P<0.05)。2个群体Sc-GYS基因多态性与生长性状的关联性分析发现,c.248C>T位点与缢蛏的总重、软体重性状显著相关(P<0.05);c.260C>G位点与缢蛏生长性状相关性高(P<0.05);c.839T>C位点与缢蛏的壳长、总重、软体重性状显著相关(P<0.05),这些位点与显著相关的性状均表现为缢蛏纯合子均显著低于杂合子个体(P<0.05),呈现杂合子优势。2个群体缢蛏Sc-GPH基因编码区的SNPs与生长性状的关联分析结果显示,c.420G>A位点处基因型GG缢蛏个体的总重显著低于基因型GA个体(P<0.05);c.867T>A、c.1284T>A位点处基因型TT的缢蛏个体的软体重显著高于基因型TA(P<0.05)。
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