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2007年3月-2008年11月,到广西北部的兴安、永福、罗城、金城江区、乐业、田林、三江、融水等县不同林地共采集130份土壤标样,在实验室分离得腐霉菌株260株,初步探明广西北部林地腐霉的种类有17种,分别为棘腐霉、刺腐霉、昆明腐霉、孤雌腐霉、瓜果腐霉、缺性腐霉、南宁腐霉、浮游腐霉、乳突腐霉、刺器腐霉、终极腐霉、逸见腐霉、德里腐霉、间型腐霉、钟器腐霉、镰雄腐霉、宽雄腐霉。其中棘腐霉和刺腐霉出现的频率最高,分布最广,为优势种;其次是缺性腐霉,瓜果腐霉和昆明腐霉,以上5种为主要种群。
在广西北部的各个样区中,以罗城的腐霉种类最多,分离得13种;其次是金城江和乐业,均为9种,以田林的腐霉种类最少,仅分离到3种。从不同林分土壤分离到的腐霉种数不同,在针叶林、阔叶林地中各分离到9种腐霉,桉树林地分离到8种腐霉,竹林样土中培养出的腐霉的种类最少仅为4种。不同林分类型的腐霉的分离率也有差别,针叶林林区的腐霉分离率较高,达到34.25%,桉树林林区的腐霉分离率也有31.25%;而阔叶林林区的腐霉分离率只有27.5%;竹林区的腐霉分离率较低,仅为26%。林地表土层(0~10 cm)的分离率为较高。在101~2100 m各个海拔之间不同海拔林地的腐霉的分离率相差不大,以101~300m海拔的标样分离率略高,分离率达到35%。
以33个腐霉的rDNA ITS为基础,以一种海生疫霉和两种疫霉为外群,按邻接法构建系统发育树,对腐霉属中代表各种形态性状菌株与DNA序列之间的关系进行了分析。分子系统树的结构表明,孢子囊为球形或者亚球形的腐霉构成第一集团,孢子囊为丝状或裂片状者构成第三集团,中间形成第二集团,属于过渡集团,其特征是两种特征的混合,包含两种形态类型的混合群体,包含孢子囊为球形或者亚球形的,也有孢子囊是丝状或者裂片状的,藏卵器壁光滑与不光滑两种类型皆有。第三集团内部还可以区分为卵孢子满器和不满器两个组群。分子系统树体现腐霉孢子囊的形态特征由球形或亚球形逐步过渡到丝状或裂片状,是腐霉分类的第一重要特征,卵孢子满器或不满器成为第二重要特征。藏卵器表面都是光滑与有突起的在以ITS建立的系统树中尚不能区分成不同的组群。
通过建立分子系统发育树,可以看出自测的4个菌株序列与GenBank上的权威菌株聚集在一起,具有很高的同源性,表明通过建立分子系统发育树,将有可能成为腐霉分子鉴定的重要手段。