【摘 要】
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选择信号是物种在进化过程中,经历长期的自然和人工选择在基因组上所留下的印迹。选择信号检测不仅能反映选择对品种的培育作用,还有助于更好地理解选择机制。海南猪、五指山猪、两广小花猪是我国华南地区优秀的地方品种,具有耐粗饲、性成熟早、肉质鲜美等优点。杜洛克猪经历了长时间的正向选择,具有生长速度快、饲料转换率高、瘦肉率高等特点。本研究基于Gene Seek Genomic Profiler（GGP）Pro
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选择信号是物种在进化过程中,经历长期的自然和人工选择在基因组上所留下的印迹。选择信号检测不仅能反映选择对品种的培育作用,还有助于更好地理解选择机制。海南猪、五指山猪、两广小花猪是我国华南地区优秀的地方品种,具有耐粗饲、性成熟早、肉质鲜美等优点。杜洛克猪经历了长时间的正向选择,具有生长速度快、饲料转换率高、瘦肉率高等特点。本研究基于Gene Seek Genomic Profiler（GGP）Procine SNP80芯片、Illumina SNP 60K芯片以及GGP Procine SNP50芯片,利用相对扩展单倍型纯合度检验,对杜洛克猪群体进行选择信号检测;随后,利用种间单倍型纯合度检验、FST统计量对华南地区6个品种（亚群）及杜洛克猪进行品种间选择信号检测,旨在探究不同猪品种由于选择造成的基因组印迹的差别,同时利用生物信息学数据库分析选择信号所反映的生物学信息。研究结果如下:1)在杜洛克猪基因组中检测到154个潜在受选择区域,共注释到551个候选基因,富集到9个GO生物学过程及5条KEGG通路。与潜在受选择区域重叠的QTL（quantitative trait locus）多与平均日增重等性状有关。2)以海南地区地方猪种（五指山猪、海南猪）为实验群,杜洛克猪为参考群:在实验群中未检测到潜在受选择区域;在参考群中检测到6个潜在受选择区域,共注释到6个候选基因,其潜在受选择区域多与影响猪100 kg日龄的QTL重叠。3)以两广小花猪为实验群,杜洛克猪为参考群:在实验群中未检测到潜在受选择区域。在参考群中检测到2个潜在受选择区域,共注释到1个候选基因,其潜在受选择区域多与影响天冬氨酸转移酶活性的QTL重叠。4)以海南地区地方猪种（五指山猪、海南猪）为实验群,两广小花猪为参考群:在实验群中检测到2个潜在受选择区域,注释到7个候选基因,其潜在受选择区域多与影响初情期启动日龄、胸膜肺炎放线杆菌易感性的QTL重叠。在参考群中检测到13个潜在受选择区域,注释到28个候选基因,13个潜在受选择区域多与影响肉质性状（肉色、滴水损失、剪切力）的QTL重叠。综上所得,杜洛克猪受选择方向集中于生长性状等;海南地区地方猪种受选择方向集中于初情期启动日龄,两广小花猪受选择方向集中于肉质性状等。
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