【摘 要】
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自抑域是广泛存在于各种蛋白质中的一种结构域。在缺少激活剂的情况下,它能够通过抑制蛋白质活性的方式来调节蛋白质在细胞内行使的功能。本实验以已知的蛋白质自抑域为研究对象,对其生物信息学特性和可能的作用机制进行了分析,并对选取的蛋白质进行全序列分析、全序列比对、自抑域序列比对、进化树构建与分析以及膜拓扑结构分析等生物信息学研究。P2B型ATP酶是P型离子泵超家族的成员,对它们的自抑域基本特性和可能的作用
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自抑域是广泛存在于各种蛋白质中的一种结构域。在缺少激活剂的情况下,它能够通过抑制蛋白质活性的方式来调节蛋白质在细胞内行使的功能。本实验以已知的蛋白质自抑域为研究对象,对其生物信息学特性和可能的作用机制进行了分析,并对选取的蛋白质进行全序列分析、全序列比对、自抑域序列比对、进化树构建与分析以及膜拓扑结构分析等生物信息学研究。P2B型ATP酶是P型离子泵超家族的成员,对它们的自抑域基本特性和可能的作用机制进行了分析。研究表明在所选取的P2BATP酶自抑域中存在着十分保守的氨基酸序列,这些序列在自抑功能的行使中发挥着重要的作用；各蛋白自抑域序列的进化关系可以很好的反映出各蛋白之间的进化关系。CRKs是钙依赖型蛋白激酶,我们以研究比较清楚的CDPK为参照,首先推测CRKs家族的自抑域序列,然后分别以两个家族成员的全序列和自抑域序列构建进化树,试图从自抑域的保守性及进化的角度阐明CRKs的自抑域及其自抑机制。CaVl家族是一个包括K+电压门控通道和Na+电压门控通道的跨膜离子通道蛋白质超家族的成员,对其四个成员进行了全序列比对、自抑域序列比对和进化树构建以及膜拓扑结构分析等生物信息学手段,对它们自抑域的特性进行了研究。发现所选取的CaVl自抑域中存在着十分保守的氨基酸序列,这些序列在自抑功能的行使中发挥着重要的作用；各蛋白自抑域序列的进化关系可以很好的反映出各蛋白之间的进化关系。
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